O leite é um alimento de importância reconhecida para a saúde da população, por ser economicamente acessível e nutritivo. Justamente por seu alto valor nutritivo, também é propício ao desenvolvimento de microrganismos que, se presentes, podem causar graves doenças aos consumidores. Sendo assim, o trabalho propõe a caracterização microbiológica do leite cru e pasteurizado produzido pelo setor de bovinocultura de leite do IFB, Campus Planaltina (IFB-PLA), que apresenta características produtivas de base agrofamiliar. A pesquisa constitui-se da pasteurização lenta em sistema de batelada a 65ºC por 30 minutos, seguida de resfriamento. Para as análises foram coletadas amostras de leite cru e pasteurizado. As análises microbiológicas realizadas foram determinação de mesófilos aeróbios, fungos e leveduras, também foi determinada a atividade enzimática de fosfatase alcalina e peroxidase. Os resultados demonstraram que o produto pasteurizado estava dentro dos padrões aceitáveis para a contagem de mesófilos, fungos e leveduras, menos de 1,0 UFC/mL. Já no leite cru foi obtida quantidades variando de 1,1x106 a 3,0x106 UFC/mL. Quanto às análises da atividade enzimática 100% das amostras de leite pasteurizado apresentaram fosfatase negativa, enquanto que 50% das amostras apresentaram peroxidase negativa, indicando utilização de temperatura mais elevada, o que mascara a alta carga microbiológica do leite além de provocar alterações físicas, químicas e sensoriais do leite. Conclui-se então, que o leite pasteurizado apresenta-se adequado quanto aos microrganismos analisados conforme exigências da instrução normativa Nº 62 de 2011 e Resolução RDC Nº 12 de 2001, tornado o tratamento térmico controlado uma etapa obrigatória para a segurança alimentar.