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Guilherme Duarte Ramos Matos e 2 outras pessoas responderam o tópico "Aplicação a outros tipos de reação"

Publicação: Infrared intensities of imaginary frequencies: Gas-Phase SN2 Transition States

Parabéns pelo trabalho interessante!

Eu tenho um pergunta relacionada a aplicabilidade desse método ao estudo de mecanismo de reação: suponha que esteja estudando uma reação cujo mecanismo é incerto. Há algumas hipóteses com várias etapas plausíveis que levam ao mesmo produto final. Se as energias de cada intermediário e de cada estado de transição já forem conhecidas, existe alguma forma de, ceteris paribus, usar as componentes do CCTDP para determinar qual seria o mecanismo mais provável, ou seria esse um "passo maior que as pernas" para o método? Há alguma relação entre as energias de ativação e as intensidades da frequência negativa?

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gunar mota e outra pessoa responderam o tópico "Isomerização, cinética e estados excitados"

Publicação: Fragmentation Route of doubly ionized benzene, aniline and nitroanilines monomers using a novel protocol from density functional theory

Olá Gunar! A fragmentação de dicátions é um processo extremamente complexo devido as reações de isomerização e da possibilidade de termos estados eletrônicos com energias próximas ao longo das rotas de dissociação. Como é possível validar sua hipótese usando modelos simples sem levantar em conta a cinética da fragmentação e os demais estados eletrônicos? Além disso, é sabido que dicátions oriundos de moléculas aromáticas apresentam reações de isomerização, por que outras estruturas não foram consideradas?

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Marco Aurélio Euflauzino Maria respondeu o tópico "A nova parametrização para o Sarin e seus derivados"

Publicação: Sarin-air mixture filtration by a porous rGO: a molecular dynamics study

Olá Marco.
Parabéns pelo excelente trabalho.

Para mostrar que as propriedades observadas independem dos parâmetros, eu gostaria de sugerir que, se possível você avalia-se os novos parâmetros para o Sarin e os seus derivados publicados recentemente:

"Force Fields for Molecular Modeling of Sarin and its Simulants: DMMP and DIMP"
Alina Emelianova, Elizaveta A. Basharova, Andrei L. Kolesnikov, Evaristo Villaseco Arribas, Ella V. Ivanova, and Gennady Y. Gor*
Cite this: J. Phys. Chem. B 2021, 125, 16, 4086–4098
Publication Date:April 19, 2021
https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.0c10505

Contudo, a pergunta é se a interação do sarin ocorre entre o O2s e Hhyd e Hcarb, como este efeito afeta a pressão?

Muito obrigado.

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Ana Carolina Ferreira de Albuquerque respondeu o tópico "Metodologia de Cálculo"

Publicação: Estudo da estrutura tridimensional de peptídeos zíperes de triptofano através de cálculos de deslocamentos químicos de ¹H e simulações de Dinâmica Molecular

Boa noite Ana, obrigado pela apresentação. Na sua metodologia você disse que retirou um frame a cada 100 ps e realizou a otimização da geometria no nível HF/3-21G. Pergunta(s): 1) como este nível de cálculo irá afetar os seus resultados pois, a base além de ser pequena não inclui polarização e o método não inclui correlação eletrônica. (2) não seria melhor pegar as estruturas vindas diretamente da simulação e obter os dados de RMN de forma média sobre as configurações ? Qual o impacto dos diferentes tipos de volta beta ? Me desculpe mas eu não entendi pois, independente do tipo, continua sendo volta beta.