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Quantum Chemistry study of the Pt(II,IV) complexes structures with anticancer activity
Gloria Maria Castañeda-Valencia
Universidade Federal Fluminense
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Parameters for Platinum (Pt) atom are available only for some programs restricted and commercial.
DockThor from LNCC (Brasil) is a free web server for docking but lacks parameters for Pt atom.
We studied molecular geometry of 22 complexes Pt(II, IV), as the first part of parametrized Pt atom.
By DFT, functional M06L and relativistic correction ZORA / SARC (for Pt) in the basis set.
Less dispersed: bond distance Pt-Cl and angle ClPtCl. Geometries are agreement with available data.
These and other were calculated, it will be used for parametrize Pt and applicate in DockThor.
Sidney Ramos Santana
Olá Glória.
Parabéns pelo trabalho.
Por gentileza, vocês investigaram os efeitos de solventes. Eles são importantes na descrição de parâmetros em meio biológico.
Há uma iniciativa para a parametrização de compostos de coordenação pelo grupo do Prof. Hélio F. dos Santos. da Universidade Federal de Juiz de Fora, de uma olhada no artigo:
Yesylevskyy, S., Cardey, B., Kraszewski, S. et al. Empirical force field for cisplatin based on quantum dynamics data: case study of new parameterization scheme for coordination compounds." J Mol Model 21, 268 (2015). https://doi.org/10.1007/s00894-015-2812-0
Muito obrigado.
Rodrigo da Silva Bitzer
Olá Gloria,
Parabéns pelo trabalho! Restou-me uma dúvida. Você também calculará as cargas parciais para incluí-las na paremetrização? Se sim, que método você usará?
Gloria Maria Castañeda-Valencia
Saudações prezado Rodrigo da Silva! Sobre as cargas, sim calculamos as parciais atômicas, neste caso as mais focadas na parametrização foram as cargas Chelpg e Resp. o método foi cálculo quântico. Muito obrigada por seu comentario!
Gloria Maria Castañeda-Valencia
todo os cálculos que apresentamos nesta oportunidade, no video, foram quânticos :-) e métodos: chelpg, resp. e além mediante análise de populações as Mulliken.
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Gloria Maria Castañeda-Valencia
Muito obrigada por seu comentario, prezado Sidney Ramos! Ainda nao investiguei efeito de solvente, e sim realmente é importante mais ainda pela troca de ligantes por agua que acontece no meio biologico. Me deixou curiosa e vou revisar o artigo que vc menciona, eu ja li outros artigos do professor Helio mas esse ainda não. Agradeço !