Sucos de frutas vêm sendo estudados como potenciais carreadores para incorporação de probióticos na dieta. A aplicação da técnica de microencapsulação por spray drying em sucos probióticos é uma alternativa promissora que permite a conversão dos mesmos em produtos em pó com maior estabilidade, minimizando a perda da viabilidade desses microrganismos. O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do processo de microencapsulação por spray drying do suco de maracujá adicionado de Bifidobacterium animalis ssp. lactis BB-12, e avaliar a viabilidade da cultura probiótica nas microcápsulas durante o armazenamento a 4°C. Foram obtidas duas formulações de microcápsulas, combinando-se o suco adicionado de probióticos com maltodextrina (SM) ou inulina (SI) como agentes encapsulantes, na proporção de 20 % (m/v). A contagem de células viáveis foi determinada nas soluções de alimentação, antes da secagem, e nas microcápsulas ao longo de 45 dias (0,15, 30 e 45) de armazenamento. A eficiência de encapsulação (%) foi calculada como a razão entre o número de células viáveis liberadas das microcápsulas e o número de células presentes nas soluções de alimentação (em base seca). Para ambas as amostras foram obtidos valores de eficiência de encapsulação superiores a 70 %, considerados satisfatórios. Todavia, o uso de inulina resultou em maior eficiência de encapsulação para a amostra SI em comparação com a amostra SM, com valores correspondentes a 86,67 % e 79,11 %, respectivamente. A contagem de células viáveis foi mantida acima de 6 log UFC/g durante todo período de estocagem das amostras. Ao longo do armazenamento, foi observado um aumento nas contagens de células viáveis, em comparação com a contagem inicial, para ambas as amostras. Os resultados mostraram que os agentes encapsulantes empregados foram eficientes na proteção das bifidobactérias durante o processo de microencapsulação, bem como durante o período de estocagem das microcápsulas, garantindo suas propriedades probióticas.