A Região Nordeste apresenta grande importância no cultivo de espécies frutíferas tropicais, pois possui condições climáticas satisfatórias. O número de agroindústrias instaladas na região e a capacidade de processamento têm aumentado significativamente nos últimos anos, gerando um incremento na produção de resíduos agroindustriais não utilizáveis na alimentação humana (LOUSADA JÚNIOR et al., 2006) que, na maioria das vezes, são dispostos no ambiente, utilizados como fertilizante orgânico ou na alimentação animal, sem qualquer tratamento. A geração excessiva desses resíduos e seu descarte no ambiente podem acarretar danos. Por isso, o aproveitamento de subprodutos do processamento de frutas para a obtenção de componentes com características funcionais, inclusive bactérias acido láticas (BAL) com potencial probiótico, pode ser considerado uma alternativa promissora com vistas a sua inserção em diversos alimentos. A partir de subprodutos do processamento de polpa de maracujá foram realizados ensaios objetivando isolar e caracterizar BAL. O isolamento foi realizado inoculando-se as diluições dos subprodutos em Ágar MRS e M17 a 37 e 32ºC sob anaerobiose /48 horas. Posteriormente 59 isolados (30 em MRS e 29 em M17) foram submetidos à repicagem e em seguida foram realizados testes de coloração de Gram, microscopia, atividade de catalase e teste de fermentação de glicose. Foram identificados 31 isolados gram positivos, catalase negativos e não produtores de gás. A partir das micrografias puderam ser observados cocos, bacilos longos e cocobacilos. Os testes indicaram potencial dos resíduos quanto ao isolamento de BAL, podendo estes isolados serem submetidos à avaliação de potencial probiótico para inserção em alimentos.