O tratamento de águas residuais com microalgas tem atraído interesse crescente, pois pode apresentar dupla função, tratar a água residual removendo com eficiência a matéria orgânica, e por outro lado na produção de biomassa microalgal. O estudo teve como objetivo analisar a produtividade de biomassa microalgal a partir da conversão de matéria orgânica presente na água residuária em cultivo heterotrófico da Phormidium autumnale. O experimento foi conduzido em um biorreator de coluna de bolhas com relação/diâmetro (L/D) igual a 1,28, com volume de trabalho de 2L contendo água residuária do abate de aves e suínos. As condições experimentais utilizadas foram: razão carbono/nitrogênio de 30, concentração inicial de inóculo de 100 mg.L-1, pH 7,6, temperatura de 40°C, aeração constante de 1VVM (volume de ar por volume de meio por minuto), ausência de luminosidade, o tempo de residência celular de 144 horas. O fator de conversão da matéria orgânica em biomassa foi de aproximadamente 0,66 mg/mg obtendo uma produtividade de biomassa 15,93 mg/Lh no término do experimento.