Diversidade genética e diferenciação entre grupos Bourbon, Cavimor e Wush-Wush baseada em marcadores SSR

Vol. 6, 2025 - 344711
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Estudos de diversidade são vitais para identificar alelos favoráveis e evitar redundâncias em coleções. Todavia, sua aplicação ainda é limitada, dificultando a seleção precisa de genótipos superiores e  otimização de recursos visando o ganho genético a longo prazo. Este trabalho teve como objetivo caracterizar e avaliar a diversidade genética de cultivares de Coffea arabica. Foram avaliados 69 acessos de cultivares de Bourbon (BB 33), Cavimor (CV 21) e Wush-Wush (WW 15). O experimento foi instalado em Viçosa-MG (20°45 '28.98 "S 42°52' 12.95"W, 658 m de altitude) em 2025, em delineamento de blocos completos casualizados, com três repetições. Amostras foliares foram coletadas nas diferentes repetições no ano de 2026, liofilizadas e extraídas obtendo-se o DNA genômico. A análise de agrupamento foi realizada por meio do Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean - UPGMA a partir dos marcadores polimórficos. A diversidade genética de cada grupo foi estimada pela diversidade gênica de Nei (He), enquanto os genótipos multilocus (MLGs) foram identificados a partir dos perfis alélicos obtidos com  marcadores SSR. Os componentes de variância e a diferenciação genética entre os grupos foram estimados por meio da Análise de Variância Molecular (AMOVA), e a significância estatística via teste de permutação de Monte Carlo. A análise dos seis marcadores SSR, distribuídos em diferentes regiões do genoma de Coffea arabica, revelou um total de 13 alelos, com variação de 1 a 3 alelos por loco e média de 2,33 alelos por marcador. O ponto de corte definido pelo teste de Mojena, demonstrou que os genótipos apresentaram alta variabilidade genética, agrupados em V grupos distintos com o grupo V subdividido em quatro subgrupos (a,b,c e d). A análise  de diversidade revelou que os grupos IV e V foram os mais representativos da população, abrangendo 15.5% e 54.9% dos acessos, respectivamente o acesso BB-UFV-129R3 (Grupo III) apresentou-se isoladamente, sugerindo um perfil genético singular em relação ao restante da população. Foi observada a ocorrência de perfis moleculares idênticos, evidenciando alta redundância genética, como verificado no Grupo IV, que apresentou o menor índice de diversidade de Nei (9,5%) e uma taxa de similaridade genotípica de 81,8%. Entre os acessos com perfis idênticos, destacam-se as repetições do acesso CV-UFV-100 (R1, R2 e R3) no Grupo I. Ademais, a série de acessos WW no Grupo IV aponta para uma menor segregação nesse grupo, por ser um material não melhorado. A AMOVA, validou a eficiência proposta pelo agrupamento UPGMA demonstrando que maior parte da variação total (68,2%) está concentrada entre os grupos. A diversidade genética média de Nei para a população foi de 34,2%, sendo o Grupo II o mais heterogêneo (41,2%). Observou-se ainda, divergência genética entre genótipos de mesma origem, com repetições alocadas em grupos distintos como BB-UFV-117 R1, R2 e R3 que compuseram os grupos IV e I respectivamente indicando variabilidade genética intraespecífica e ampliação do pool gênico dos acessos em estudo. Tais resultados fornecerão subsídios para seleção efetiva de genitores orientando estratégias de melhoramento genético.

 

 

 

 

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Institutions
  • 1 Universidade Federal de Viçosa – UFV
  • 2 UFV - Universidade Federal de Viçosa
  • 3 Universidade Federal de Viçosa
Track
  • 1. Molecular biology and biotechnology
Keywords
Coffea arabica
marcador molecular
germoplasma
melhoramento genético
diversidade genética