Métodos para a determinação da estrutura tridimensional de proteínas e nanopartículas

- 321898
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A determinação da estrutura tridimensional de moléculas biológicas e nanopartículas é um problema de grande interesse em química, biologia e áreas relacionadas, já que possui grande impacto nas propriedades físico-químicas dessas substâncias. Através da utilização de dados experimentais obtidos por técnicas como a ressonância magnética nuclear e o método da função de distribuição de pares, torna-se possível determinar estruturas tridimensionais de proteínas e nanoestruturas. Estes são exemplos de instâncias do problema de Geometria de Distâncias Não Associadas (uDGP), onde o objetivo principal é determinar as posições de pontos específicos com base em um conjunto de valores de distância que não foram previamente atribuídos a pares de pontos específicos. Apresentam-se, neste trabalho, novas formulações de programação matemática e uma abordagem heurística para resolver o uDGP. Nossos resultados demonstram o desempenho superior dos modelos propostos em comparação com os métodos existentes documentados na literatura.

 

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Institutions
  • 1 Insituto Militar de Engenharia
  • 2 Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ)
Track
  • ST12 - Optimization
Keywords
Geometria de Distâncias
Programação Matemática
Otimização