As raias pertencem à superordem Batoidea, o grupo mais diverso de Chondrichthyes em termos de espécies válidas e disparidade morfológica. O uso de dados morfológicos e moleculares para inferir as relações de parentesco entre as raias tem resultado em hipóteses filogenéticas divergentes. Caracteres associados ao coração e vasos sanguíneos não foram considerados em hipóteses filogenéticas de Batoidea baseadas em morfologia e pouco se sabe sobre a variação anatômica deste complexo em raias. No presente estudo, representantes de 32 gêneros classificados em 19 famílias das 4 ordens atualmente reconhecidas de raias foram examinados e oito caracteres são descritos e propostos. Espécimes de tubarões também foram examinados como material comparativo. O arranjo das artérias branquiais aferentes varia entre as ordens e famílias de raias mas poucas diferenças são encontradas em nível de gênero. Em todos os exemplares examinados (exceto no torpedinídeo Tetronarce), a aorta ventral estende-se como um único vaso entre a base da segunda artéria branquial aferente e a inominada anterior. Diferenças no comprimento relativo da artéria inominada anterior, na ocorrência, comprimento relativo e posição da artéria inominada posterior, e no padrão de ramificação entre as três artérias branquiais aferentes mais posteriores foram observadas. A condição na qual três artérias branquiais aferentes se ramificam a partir da artéria inominada posterior é proposta como sinapomorfia de Batoidea e a relação mais próxima entre a segunda e terceira artérias como sinapomorfia de Rajiformes. Caracteres associados às artérias branquiais aferentes revelaram-se úteis para fins sistemáticos e informações adicionais são necessárias para melhor compreensão da evolução deste complexo em elasmobrânquios.