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O crescente interesse pelos cafés clonais dos Robustas Amazônicos torna essencial a realização de estudos para compreender suas características genéticas, ainda pouco exploradas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade genética desses cafeeiros. Para isso, 10 marcadores moleculares distribuídos aleatoriamente ao longo do genoma e 62 genótipos foram selecionados. Foi observado um total de 54 alelos por loco, com uma média de 5,4 alelos por marcador. O índice médio de conteúdo de informação polimórfica (PIC) foi de 0,48-0,91 e de poder discriminatório (DP) >0,70, confirmando a eficiência dos marcadores selecionados para discriminar os genótipos. O dendrograma gerado pelo método UPGMA agrupou os indivíduos em oito grupos principais, com uma distância média de 0,62, com a formação de dois grupos maiores que reuniram a maioria dos clones. A análise de coordenadas principais (PCoA) explicou 38,42% da variabilidade observada, demonstrando uma ampla dispersão entre os genótipos, indicando a elevada diversidade genética. Alguns clones e cultivares se destacaram por sua divergência, enquanto outros se agruparam próximos, sugerindo relações genéticas mais estreitas. Esses resultados demonstram a ampla base genética dos Robustas Amazônicos, com potenciais genótipos para seleção de genitores divergentes e para a conservação eficiente do germoplasma.
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