Identificação e validação de marcadores genéticos para diferenciação de grupos varietais de Coffea canephora por genômica comparativa

O Brasil é o maior exportador de café, produzindo as duas variedades de maior interesse agronômico: arabica e canephora. O café canephora abrange dois grupos varietais: Conilon e Robusta e atualmente não existem marcadores moleculares capazes de distinguir esses grupos varietais de forma efetiva. Neste trabalho, foi realizado a identificação de marcadores genéticos, visando discriminar os grupos varietais de Coffea canephora: Conilon e Robusta com base em técnicas moleculares. Para atingir esse propósito, realizamos um estudo de genômica comparativa na identificação de mutações de inserção-deleção em ortólogos cópias simples entre C. arabica e C. canephora para selecionar sequências de DNA que tiveram deleção entre as duas espécies e validamos utilizando perfil eletroforético e análise da curva de melting de alta resolução (HRM). Essa estratégia permitiu selecionar um marcador que apresentou perfil contrastante entre os grupos Conilon e Robusta. Este estudo contribui para o melhoramento genético e rastreabilidade de amostras, uma vez que permite identificação dos genótipos de forma mais eficaz e simples que abordagens baseadas em marcadores de base única (SNPs). Com isso, fornecemos o primeiro marcador de seleção para grupos varietais de C. canephora, aplicáveis na seleção de material genético para banco de germoplasmas e rastreabilidade de amostras.