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COMPUTATIONAL STUDY OF Pt-195 NMR CHEMICAL SHIFT IN Pt(II) COMPLEXES WITH ANTITUMORAL POTENTIAL
Joyce Helena Cunha e Silva
UFRJ Macaé
Agora você poderia compartilhar comigo suas dúvidas, observações e parabenizações
Crie um tópicoA cisplatina é um dos principais tratamentos aprovados para diversos tumores. Porém, os seus graves efeitos colaterais fundamentam a busca por análogos mais eficazes e seletivos. A espectroscopia de RMN vem atuando de forma significativa no desenho e descoberta de novas drogas nos últimos anos. Os complexos foram otimizados e caracterizados através de cálculos de frequência harmônica. Os deslocamentos químicos foram calculados na equação δPt-195(calc) = −0,9250σPt-195(calc)−2065,7558. Os resultados deste trabalho tiveram MRD de 3,9% e MAD de 122 ppm em relação ao valor experimental.
Eduardo Lemos de Sa
Oi Joyce
Parabéns pelo seu trabalho!! Pelo número de complexos estudados (103) é possível saber que foi um trabalho muito árduo.
Eu tenho algumas curiosidades e gostaria, por favor, que você fizesse alguns esclarecimentos:
1) Você otimiza as geometrias com um funcional/função de base (sem efeito relativístico) e depois calcula o deslocamento químico usando um outro funcional (e com efeito relativístico incluso). Esta metodologia foi testada (comparando resultados calculados com resultados experimentais) para quantos complexos de Pt(II)?
2) Quando você diz que a metodologia 3 é mais eficiente porque retira a necessidade de se calcular o deslocamento para o composto padrão de Pt, isto também não tira a possibilidade de corrigir-se erros computacionais que se anulariam? Ou seja, nenhuma metodologia é à prova de falhas mas, quando você aplica a metodologia para o padrão e para o composto estudado, estes erros poderiam cancelar-se. Na metodologia 3, não há esta possibilidade.
Obrigado por sua atenção
Eduardo
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Joyce Helena Cunha e Silva
Ola Eduardo!
Muito obrigada! Fico feliz que tenha gostado e se interessado pelo trabalho.
Como a platina é um metal pesado, obter um bom resultado utilizando a equação convencional, com a referência, sem incluir os efeitos relativisticos, é puramente um cancelamento de erro. Assim, como a ideia do trabalho em que a metodologia foi desenvolvida era obter um bom resultado sem precisar fazer o cálculo relativistico, os modelos foram construídos. A ideia dos modelos é ter algo simples e de uso em pacotes computacionais até por usuários com pouca experiência.
No desenvolvimento da metodologia, foi realizada uma regressão linear da constante de blindagem calculada versus o deslocamento Químico experimental para um conjunto de 178 complexos de Pt(II). A equação obtida, δPt-195(calc) = −0,9250σPt-195(calc)−2065,7558 (Modelo 3, por exemplo), foi utilizada para obter então o deslocamento Químico teórico. Posteriormente, o mesmo modelo foi aplicado para 78 complexos de Pt(II) diferentes dos utilizados na construção do modelo, visando a validação. E nesse trabalho que realizei, estudamos mais 103. Assim, podemos dizer que a metodologia já foi validada para um total de 359 complexos de Pt(II), obtendo um desvio relativo médio abaixo de 5%.
A vantagem da metodologia, é poder calcular uma propriedade em vários aspectos devem ser considerados no modelo Computacional, de um maneira simples e com um baixo custo Computacional. Além disso, um diferencial do trabalho são as funções de base NMR-DKH que foram desenvolvidas pelo nosso grupo exclusivamente para cálculos de RMN.
Nas referências abaixo, pode encontrar o artigo em que a metodologia foi desenvolvida, um trabalho em que um outro aluno desenvolveu de forma similar para a constante de acoplamento Pt-N, e um capítulo de livro que meu orientador publicou recentemente em que ele usa as funções de base em cálculos relativisticos escalares, obtendo bons resultados também, mostrando que as funções de base estão bem comportadas.
Com relação a forma de calcular, no modelo 3, que é o de menor custo Computacional, as geometrias foram otimizadas no nível B3LYP/LANL2DZ(Pt)/def2-SVP(Ligantes)/IEF-PCM(UFF) para os ligantes. Para o cálculo do rmn, as constantes de blindagem foram calculadas no nível GIAO-PBE/NMR-DKH/IEF-PCM(UFF). E um modelo com Hamiltoniano não relativistico, onde na geometria temos efeitos relativisticos escalares que são considerados no potencial de caroço efetivo utilizado para a platina, e no rmn as funções de base foram ajustadas relativisticamente.
Os trabalhos que mencionei:
J. Carvalho, D. Paschoal, H. F. Dos Santos, Nonrelativistic protocol for calculating the 1J(195Pt-15N) coupling constantin Pt(II)-complexes using all-electron Gaussian basis-set, Chemical Physics Letters, 745 (2020) 137279. DOI: https://doi.org/10.1016/j.cplett.2020.137279
D. Paschoal, C. Fonseca Guerra, M. A. L. de Oliveira, T. C. Ramalho, H. F. Dos Santos, Predicting Pt-195 NMR chemical shift using new relativistic all-electron basis set, Journal of Computational Chemistry, 37 (2016) 2360-2373. DOI: http://dx.doi.org/10.1002/jcc.24461
D. F. S. Paschoal, M. S. Gomes, L. P. N. Machado, H. F. Dos Santos, Basis Sets for Heavy Atoms. In: E. Perlt (eds). Lecture Notes in Chemistry: Basis Sets in Computational Chemistry. Springer, 2021. vol. 107, p. 183-214. DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-030-67262-1_7