Desenvolvimento de parâmetros compatíveis com o campo de força CHARMM36 para clusters [Fe4S4]2+ e simulações de dinâmica molecular da adenosina-5’-fosfosulfato redutase no GROMACS 2019

Vol 21, 2021 - 140304
Apresentação de Pôster / Poster Communications
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Abstract

A falta de parâmetros para [Fe4S4]2+ dificulta estudos de dinâmica molecular da APSrAB.
Parâmetros para [Fe4S4]2+ foram obtidos por cálculos de DFT e validados com simulações da APSrAB.
A análise dos parâmetros inseridos no campo de força esteve de acordo com os dados experimentais.

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Institutions
  • 1 Universidade Federal do Rio de Janeiro
Track
  • Molecular Dynamics
Keywords
adenosina-5’-fosfosulfato redutase
clusters [Fe4S4]2+
Parametrização de campo de força CHARMM36
GROMACS 2019