Procesamiento de imágenes de fotografía y microscopía electrónica en el software ImageJ involucrando fósiles con variación composicional

Vol 1, 2025 - 326375
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En la fosilización por mineralización autigénica, los compuestos químicos presentes en el material fosilizado informan sobre el proceso tafonómico al que el organismo fue sometido. Para esto, se utilizan diversos métodos de análisis composicional. Eventualmente, se requieren cálculos de espesores de estructuras con composiciones diferentes para objetivos taxonómicos o tafonómicos. En el caso de las muestras utilizadas en este trabajo, se emplearon FIB-STEM, MEB, EDS, SR-micro XRF y fotografías convencionales para caracterizar la composición de insectos fósiles de la Fm. Crato (Cretácico). El análisis de imágenes que contienen áreas con diferentes composiciones facilita el estudio de la distribución elemental en un cuerpo fosilizado y, por lo tanto, permite la determinación del espesor de estructuras anatómicas, facilitando la comprensión de la secuencia de mineralización ocurrida. El procesamiento inicial de las muestras para la identificación de espesores se realiza de manera manual y visual utilizando el software ImageJ. Es posible seleccionar cada intervalo de puntos y secciones deseadas, calculando sus áreas, pero con un costo de trabajo extenso, ya que a medida que aumenta la complejidad de la imagen (heterogeneidad composicional), también lo hace el tiempo de medición, representando un desafío a superar. Con el fin de satisfacer esta demanda, presentamos un método de automatización del uso del software con códigos externos, que acorta el tiempo de identificación de estructuras de composición diferente en una fotografía o micrografía (por retrodispersión de electrones validada por mapa de EDS), permitiendo así el cálculo de espesores. La automatización implementada consiste en la asociación de códigos en Python y lenguaje de macro de ImageJ (IJM), para mapear la imagen, seleccionando cambios en la intensidad del color, con su coordenada asociada, dado un parámetro de validación variable. A partir de los puntos seleccionados, es posible obtener la reconstrucción visual como forma de validación, la elaboración de gráficos de la variación de la composición en función del espesor de la muestra y cálculos de distribución de las diferentes composiciones. En dos muestras (FIB-STEM-EDS y fotografías convencionales con mapas de SR-micro XRF), fue posible el mapeo, la identificación y el cálculo de espesores de estructuras con variaciones composicionales. La herramienta demostró ser eficiente en la reproducción visual de las muestras y en la cuantificación de áreas con composiciones distintas, validando su aplicación en estudios de fosilización. [FAPESP 2025/02782-3, 2023/14250-0, 2023/04501-6, 2022/06485-5]

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  • Límites tafonómicos
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