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A identificação rápida de genótipos de tomate pode apoiar programas de melhoramento, controle de qualidade e rastreabilidade na cadeia produtiva. O objetivo deste trabalho foi desenvolver modelos de classificação para discriminar os genótipos de tomates Coronel e Mercatto por espectroscopia Vis-NIR portátil. O banco de dados foi composto por 495 espectros, sendo 242 da classe Coronel e 253 da classe Mercatto, obtidos com o espectrômetro F-750 na faixa de 396 a 1131 nm. As amostras foram distribuídas em conjuntos de treinamento, com 346 espectros, e teste, com 149 espectros. Os dados espectrais foram pré-processados por correção multiplicativa de espalhamento associada ao filtro de Savitzky-Golay com janela de nove pontos. Foram avaliados os modelos PCA-LDA, utilizando cinco componentes principais, e PLS-DA, com quatro variáveis latentes. O desempenho foi determinado por sensibilidade, especificidade e precisão. Os espectros médios pré-processados evidenciaram diferenças entre os genótipos, especialmente na região visível, e os gráficos dos modelos demonstraram separação entre as classes. O PCA-LDA apresentou 100% de sensibilidade, especificidade e precisão para Coronel e Mercatto, tanto no treinamento quanto no teste. O PLS-DA também alcançou 100% para todas as métricas e classes nos dois conjuntos. Conclui-se que a espectroscopia Vis-NIR portátil associada à análise multivariada possui elevado potencial para a identificação rápida e não destrutiva dos genótipos Coronel e Mercatto, podendo contribuir para a rastreabilidade de tomates.
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