A presente pesquisa teve por objetivo analisar as produções científicas em formato de artigos veiculados em períodos sobre a temática instituições especializadas e Educação Especial. Trata-se de um estudo quali-quantitativo, de abordagem metodológica bibliométrica e de análise de conteúdo. Os resultados apontaram que 48 artigos publicados em 27 periódicos, elaborados por 90 autores, 103 contribuições, entre o período de 2003-2015. Foram identificadas 38 diferentes instituições de Ensino Superior concentradas, majoritariamente, na Região Sudeste e de dependência administrativa pública. Constatou-se também que as temáticas versam sobre o contexto atual de políticas da área da educação e saúde voltadas para as pessoas com deficiência, visando sua inclusão social. A produção acadêmica analisada apresenta diferentes objetivos e resultados. O foco das pesquisas abrange temas relacionados ao perfil dos professores, ao perfil clínico-social dos alunos de instituições especializadas, à oferta da Educação Profissional, aos contextos da inclusão escolar, e aos sentidos e significados e práticas nas instituições especializadas. Os resultados apresentam os desafios e as possibilidades de garantir o desenvolvimento integral das pessoas com deficiência. Portanto, é necessário repensar a formação de professores, as práticas pedagógicas e as políticas públicas na relação instituição especializada e Educação Especial.