Boa tarde Jhéssica, tudo ótimo. Fico muito feliz que tenha gostado do trabalho. Bom, respondendo suas questões na ordem:

1) Sim, há diversos relatos associando as excretas de pombos a casos de meningite criptocócica e criptococose. Por conta disso e pela vasta presença desses animais na universidade (no Instituto de Biologia, por exemplo, há dois ninhos no corredor principal entre os blocos dos laboratórios e salas de aula) foi estudado a sua presença nas excretas. Também por ser mais comum casos de patologia associados as leveduras (normalmente encontradas nos excrementos de aves) do que as formas filamentosas (geralmente encontradas em cascas de eucaliptos).

2) Os pombos não são infectados pelo C. gattii ou pelo C. neoformans (pelo menos não foram encontrados registros na literatura). Ocorre que tanto a forma levedureforme quanto a forma filamentosa se alojam no papo dos pombos (por dispersão de basidiósporos no ar, contato direto quando o pombo se alimenta em algum local contendo o fungo) e se comportam como endosaprófitos pois não conseguem sobreviver internamente devido à alta temperatura corporal das aves. Contudo, eles conseguem sobreviver ao trato gastrointestinal e são eliminados nas fezes permanecendo viáveis por cerca de 2 anos.

3) Nas fezes, o C. gattii e o C. neoformans permanecem por conta dos nutrientes (como a ureia) e do microambiente criado, uma vez que os pombos defecam em seus ninhos que geralmente estão protegidos da luz direta do sol (que poderia matar esses fungos). Uma vez que as fezes sequem, as leveduras do C. gattii e do C. neoformans podem ser dispersadas no ar por conta do seu peso baixo. Assim, caso uma pessoa inale essas leveduras dispersas no ar, ela estará suscetível a infecção e possíveis complicações.

4) Não, os fungos C. gattii e C. neoformans não infectam os pombos e atuam apenas como endosaprófitos nessas aves.

5) Morfologicamente eles possuem as mesmas características, mas são diferenciados pelos polimorfismos em suas sequências de DNA com o sorotipo A (também conhecido como C. neoformans var grubii), sorotipos D e AD (pertencentes ao C. neoformans) e sorotipos B e C (pertencentes ao C. gattii). Também é possível diferenciá-los fisiologicamente, uma vez que C. neoformans não consegue assimilar a glicina como única fonte de carbono e nitrogênio, contudo, por não haver isolados do gênero Cryptococcus essa diferenciação não foi abordada.

6) Inicialmente havia a ideia de coletar uma amostra por instituto para um total de 10 institutos, entretanto, a pandemia restringiu o acesso ao campus e, supõe-se que o baixo trafego de pessoas pelo campus tenha afetado a distribuição dos pombos. Dessa forma, os locais de coleta apresentados foram os únicos nos quais havia não só material suficiente para a coleta, mas a presença das aves por perto para garantir que as fezes não eram de outras espécies.

7) Por não ser o foco principal do trabalho, não foram realizados testes moleculares ou bioquímicos para a verificação de Rhodotorula spp. Esse achado, juntamente com outros fungos nas excretas dos pombos, aponta a necessidade de alguma intervenção socio acadêmica para a remoção dos ninhos e limpeza dos locais de comum acesso. Tendo em vista que Rhodotorula spp. é um fungo patógeno capaz de causar meningites, pneumonias e outras doenças, sendo responsável por cerca de 2% da fungemias relatadas em estudos epidemiológicos, um projeto mais aprofundado sobre esse fungo deveria ser realizado.

8) Seria de meu interesse dar continuidade a esse projeto futuramente, contudo, por hora, irei explorar outras áreas da biologia para ampliar meu conhecimento acadêmico. 

Eu agradeço as perguntas e o interesse no meu tema.
Com uma maior conscientização popular podemos criar medidas de prevenção para impedir que esses e outros patógenos se proliferem e causem tantas mortes.

Caso tenha mais alguma dúvida ficarei feliz em responder.

Att, Vinícius F.