To cite this paper use one of the standards below:
Please log in to watch the video
Log inIntroduction and objectives: Germline mutations in the PALB2 tumor suppressor gene are associated with breast and pancreatic cancer predisposition. It encodes for a homonymous protein with a pivotal role in genomic integrity maintenance through the homologous recombination repair pathway. PALB2 works as a scaffold protein, connecting BRCA1 and BRCA2 to promote the recruitment of the RAD51 recombinase to DNA damaged sites. Despite the growing interest in PALB2, its molecular function and gene regulation are not fully understood. Our goal is to evaluate putative new functions of PALB2 through the identification of new interaction partners and the characterization of PALB2 promoter locus, defining its regulation and minimal promoter region. Materials and methods: We performed a yeast two hybrid screening assay to identify putative new PALB2 partners. ROCK2 was recognized as a direct interaction partner. Confocal microscopy (CM) approach was applied to investigate the complex. Putative PALB2 promoter region was identified through the Genome Browser platform tracking down in silico H3k27Ac signal (euchromatin marker) upstream PALB2 gene. The selected region was generated through PCR using BJ cells genomic DNA as a template. Different deletion fragments (DF) were also generated to map the minimal promoter region. Promoter activity was assessed through a luciferase reporter expression assay in HEK293FT cells. Results and conclusion: ROCK2 was previously described as a player in centrossome together with BRCA2. CM identified PALB2 in centrosome structure, co-localizing with -tubulin (centrosome marker) during interfase and also in different phases of mitosis. We are current investigating a possible role for PALB2 in centrosome duplication together with ROCK2 and BRCA2. Moreover, we identified a 1001 nucleotide sequence upstream of the PALB2 as the putative gene promoter region (hereafter 1001). The 1001 displayed the ability to activate luciferase transcription (the reporter gene). To map 1001, DF were generated and a 224 nucleotide sequence (hereafter 224) was found to exhibit similar levels of transcription activation observed for 1001. Upon ionizing radiation (IR; 10Gy) treatment, both 1001 and 224 promote increased transcriptional activity when compared to non-IR cells. Interestingly, we also demonstrated high levels of PALB2 mRNA upon DNA damage induced both by IR (10Gy) and PARP inhibition (Olaparib 2,5uM – 10uM). Taking our data together, we demonstrated an new PALB2 subcellular localization and also a new putative interaction partner, shedding light on a novel PALB2 function. We also showed that PALB2 is upregulated upon different types of DNA damage and identified a minimal regulatory region for PALB2 expression.
Fábio César Sousa Nogueira
Prezada Anna,
Excelente e clara apresentação. Parabéns.
Você poderia explicar os pontos abaixo:
1. Tentaram validar a interação da PAB2 com ROCK2, usando ROCK2 como "bait" ou por outra técnica?
2. Qual a justificativa da expressão de PALB2 aumentar e depois diminuir ao longo da IR? Assim como com o aumento da concentração de olaparibe? O que explica este comportamento?
Obrigado e parabéns novamente.
Fábio
Luciana Ferreira
Boa tarde Anna Beatriz, meus parabéns pelo excelente trabalho! Achei incrível a caracterização da região mínima necessária para a atividade promotora. Mas eu tenho uma dúvida, qual foi o racional para selecionar os fragmentos menores de 366 e de 140 nucleotídeos? Teve um motivo específico ou foi aleatório?
Todos os experimentos foram feitos com as células HEK293T? Vocês pretendem avaliar PALB2 em células de algum modelo tumoral como mama ou pâncreas? Quais são os próximos passos do projeto?
Anna Beatriz Ribeiro Elias
Muito obrigada, Luciana.
Bem, inicialmente nós realizamos a clonagem da sequência de 1001 nucleotídeos e utilizamos de sítios de restrição intrínsecos dessa sequência para gerar novos fragmentos (como o de 366 nucleotídeos) para nos auxiliar no mapeamento dessa região. Uma vez que observamos que, dentro dos diferentes fragmentos gerados, o 366 ainda mantem a capacidade de ativação promotora, fomos mapear mais minuciosamente essa porção gerando então o fragmento de 140 e posteriormente o de 227 nucleotídeos.
Todos os experimentos utilizando o gene repórter da luciferase para verificar essa atividade promotora foram realizados em células HEK293FT. Mas nós também realizamos os ensaios em células HeLa, HCT116 e HCC1395, mas até o momento na ausência de agentes causadores de dano no DNA, onde obtivemos resultados muito semelhantes com os observados para a HEK. Estamos realizando agora o ensaio na linhagem HCC1395 (BRCA1 mutante) na presença de dano ao DNA através de Irradiação.
Como próximos passos buscamos explorar ainda mais essa sequência de 227 nucleotídeos. Estamos realizando a análise de expressão gênica de PALB2 através de diferentes fases do ciclo celular para melhor entender a regulação desse gene. E estamos também realizando pequenas deleções da sequencia de 1001 e 366 nucleotídeos com o intuito de identificar os sítios específicos nessa região promotora responsável por sua regulação e consequentemente identificar os fatores de transcrição que possam estar envolvidos nesse controle.
Luciana Ferreira
Muito obrigada pelas respostas, Anna, e mais uma vez, meus parabéns pelo belo trabalho.
Anna Beatriz Ribeiro Elias
Obrigada!
With nearly 200,000 papers published, Galoá empowers scholars to share and discover cutting-edge research through our streamlined and accessible academic publishing platform.
Learn more about our products:
This proceedings is identified by a DOI , for use in citations or bibliographic references. Attention: this is not a DOI for the paper and as such cannot be used in Lattes to identify a particular work.
Check the link "How to cite" in the paper's page, to see how to properly cite the paper
Anna Beatriz Ribeiro Elias
Boa tarde, Fábio. Muito obrigada pelas perguntas.
Bem, quanto a sua primeira pergunta, já foi realizada uma validação dos resultados obtidos no ensaio de Y2H, inclusive a possível interação entre PALB2 e ROCK2. Porém essa validação foi realizada de maneira in vitro utilizando fragmentos de ambas as proteínas (porção N-terminal de PALB2 utilizado no ensaio de Y2H e a porção N-terminal de ROCK2 pescada no mesmo ensaio). Nós agora estamos validando essa interação de duas formas: através de um ensaio de Pulldown em um sistema de células de mamífero (HEK293FT) utilizando a cadeia completa de ambas as proteínas e através da co-localização de PALB2 com ROCK2 no centrossomo através da microscopia confocal. Pretendemos ver também se essa interação ocorre de forma ciclo celular dependente, uma vez que nossa hipótese seja de que essa interação ocorra para regular a duplicação dos centrossomos - papel já caracterizado de ROCK2.
Quanto a sua segunda pergunta, nós ainda estamos investigando melhor esse fenótipo, mas nossa teoria até o momento é de que essa redução nos níveis de expressão do gene de PALB2 ocorre devido ao encaminhamento das células submetidas às altas doses de irradiação ou de Olaparibe para um quadro de morte celular e possivelmente uma mudança no quadro de expressão gênica.