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Follow the main updates and discussions about the papers published in XIV SO 2020!

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Ana Luiza Tardem Maciel and 2 other people replied to the topic "Avaliação pôster"

Publication: THE POTENTIAL INTERPLAY BETWEEN CRLF2 AND MEF2C IN T-CELL ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKAEMIA

Olá Ana Luiza,   Sou Jamila, Professora da UEZO e estou avaliando seu pôster. Parabéns pelo excelente trabalho! Por favor, poderia esclarecer as dúvidas abaixo?   O que caracteriza o perfil de expressão “único” do subtipo ETP-ALL?   MEF2C pode estar associado à desregulação da expressão de CRLF2 na leucemia linfoblástica aguda de células T. Isso já foi descrito em outros tipos de leucemias?   Pensaram em fazer uma figura para tentar explicar via/mecanismo?   Qual a aplicação do trabalho na prática clínica?     Muito obrigada e sucesso com o trabalho!   Cordialmente, Profa Dra Jamila Perini Laboratório de Pesquisa de Ciências Farmacêuticas – LAPESF UEZO https://lapesfuezo.wixsite.com/website
11/04/2020
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ANDRESA DAMASCENO replied to the topic "Avaliação trabalho "

Publication: IDENTIFICATION OF GENE FUSIONS IN ACUTE LYMPHOBLASTIC LEUKEMIA

Olá Andressa,  Me chamo Pedro Nicolau, sou pos-doc do INCA e farei a sua avaliação. Primeiramente gostaria de elogiar o resumo e o poster, bem como seus dados. Dito isto, farei algumas perguntas: 1 - Há quanto tempo você participa deste projeto e qual seu papel na execução dos experimentos? 2 - Me chamou a atenção a descrição do uso de amostras humanas para padronizar as reações de RT-PCR. Isso de fato ocorreu ou a padronização ficou restrita às linhagens? 3 - Após a padronização e confirmação da eficiência da reação não deveria ter um teste para aferir a acurácia do seu RT-PCR para predizer quem tem as fusões gênicas? Qual a técnica padrão ouro para esta identificação? São sondas taqman? ISH? Essa questão me parece relevante uma vez que a implementação desta análise na Bahia (algo digno de elogio para seu grupo de pesquisa) tem potencial para aprimorar o diagnóstico e tratamento dos pacientes com B-ALL no estado e região. 4 - Qual é o potencial impacto do seu projeto para a inovação no tratamento desses pacientes na Bahia? Fico no aguardo de suas respostas, Pedro Nicolau [email protected]    
11/04/2020
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Daniella Mattos replied to the topic "Superexpressao "

Publication: EXPRESSION PATTERNS OF OSTEOPONTIN SPLICE VARIANTS IN COLORECTAL CANCER CELL LINES

Olá Daniella, muito boa sua apresentação e este projeto tem bastante coisa pra explorar pela frente. Muito promissor. fiquei curiosa com quanto suas células estão superexpressando as isoformas. Você fez algum western ou rT-PCR ? Pergunto isso porque para os próximos estudos funcionais será importante ter um modelo robusto e a diferença que você observa na proliferação não é clara.  eu entendi de seu pôster que você vê diferença significativa de proliferação entre o tempo zero e o último timepoint especialmente para as células com as isoformas.  E acredito que, por você não colocar como significativo, está diferença não foi vista no controle. Isso significa que as células controle não estão proliferando muito ao ponto de não ver aumento neste período longo? E se você fizer uma análise relativa, Usando uma análise que compara as suas diferentes construções, você observa diferença significativa entre suas células superexpressando as isoformas e seu controle?   
11/04/2020
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Marina Chianello Nicolau Fagundes and 1 other person replied to the topic "General Questions"

Publication: THE DEREGULATION OF AID/APOBEC ENZYMES AND ITS REGULATORY MECHANISMS IN UPPER AERODIGESTIVE TRACT TUMORS

Olá Marina, tudo bem?  Gostei muito do seu resumo. Parabéns pelo trabalho bastante avançado e com diversas análises baseadas em bancos de dados importantes. Eu fiquei com algumas dúvidas ao avaliar o pôster.  Acho que seria interessante acrescentar a figura que mostra a comparação entre os níveis de expressão das APOBEC3s entre o tecido tumoral e o tecido adjacente. Esses dados são do TCGA ou da base de dados do grupo de vocês?  Vocês também observaram que amostras de OPSCC HPV -positivas se correlacionaram com maior expressão de APOBEC3s nas análises da base de dados do TCGA. Já existe alguma correlação descrita entre infecção por HPV e a expressão dessas proteínas? Vocês pretendem validar esses achados na coorte de pacientes do INCA?  Uma sugestão, acho que seria interessante colocar outras cores para diferenciar HPV-positivo e HPV-negativo, as vezes, fica um pouco difícil diferenciar o amarelo do laranja nos gráficos.  Mais uma vez, parabéns pelo trabalho.  Paula.
11/04/2020
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Brenda Graziella Thomaz da Silva and 1 other person replied to the topic "Perguntas do avaliador."

Publication: Antitumor Potential of Green Tea (Camellia sinensis) Extract on 3D Breast Cancer Cells

Imagino que seja dessa forma mesmo e posteriormente posso avaliar sua resposta. Logo, vou deixar as perguntas aqui então. 1) Você saberia informar a quantidade necessária de injestão de chá-verde necessária para chegar à concentração plasmática que vocês usaram nos ensaios in vitro? Ou seja, quanto de chá-verde ao dia eu conseguiria chegar a 162 ug/ml por exemplo. 2) Na Fig.1, do centro para a periferia, é possível observar que o controle está mais claro que os tratados. Isso significaria dizer que o esferoide parece menos denso que os tratados. Com isso, os tratados teriam mais células que o controle. O controle a que você se refere é a linhagem não tumoral? 3) Na Fig. 2, novamente do centro para a periferia, os tratados estão mais densos que o controle. Vocês conseguiriam avaliar o número de células em cada esferóide após tratamento? Além disso, é importante ressaltar que em baixas concentrações, o GTE favoreceu a viabilidade e que na concentração elevada o mesmo não foi observado. Você conseguiria explicar um motivo pela elevada viabilidade nas baixas concentrações? 4) Na Fig. 3, o mesmo foi observado nas baixas concentrações aumentado a viabilidade na MCF-10A. Você teria alguma teoria, já que foi estatisticamente significativo? O trabalho é interessante e espero que traga novas ideias para sua carreira científica. Sugiro uma abordagem mais específica sobre os subprodutos presentes no extrato de chá-verde e potencial produção de compostos análogos para serem explorados in vitro.
11/04/2020
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Jamila Alessandra Perini replied to the topic "Avaliação pôster"

Publication: FUNCTIONAL CHARACTERIZATION OF A SET OF IN-FRAME INDEL AND C-TERMINAL NONSENSE VARIANTS OF BRCA1

Olá Ana Paula,   Sou Jamila, Professora da UEZO e estou avaliando seu pôster. Parabéns pelo excelente trabalho! Por favor, poderia esclarecer as dúvidas abaixo?   Estas mutações já foram descritas em diferentes populações (quais e com qual frequência)?   Além do immunoblotting que outro experimento poderia avaliar o impacto destas mutações?   Qual a aplicação do trabalho na prática clínica?   Seria possível avaliar o impacto destas mutações em modelo animal?   Muito obrigada e sucesso com o trabalho!   Cordialmente, Profa Dra Jamila Perini Laboratório de Pesquisa de Ciências Farmacêuticas – LAPESF UEZO https://lapesfuezo.wixsite.com/website
11/04/2020
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Anna Beatriz Ribeiro Elias and 1 other person replied to the topic "PALB2 e TP53"

Publication: UNDERSTANDING THE PALB2 PROMOTER REGION AND ITS REGULATION.

Olá Anna! Parabéns pelo seu traabalho! Parece super promissor! Tenho algumas perguntas para você sobre seu trabalho. 1- Por que vocês optaram por avançar os estudos com p53, dentre os diversos putativos fatores de transcrição que vocês obtiveram a partir das análises in silico? 2- Lendo seu resumo eu tive uma interpretação dos seus dados e após ver o vídeo com a sua apresentação algumas coisas ficaram melhor esclarecidas para mim. Você apresenta muito bem e, no vídeo, não é tão enfática ao afirmar que p53 se correlaciona com PALB2. Seus dados sugerem que ele pode participar, mas você não conseguiu demonstrar pelos blottings essa correlação. Pelo menos eu não fiquei convencida, pela imagens e não pela densitometria. Entretanto, na sua apresentação você foi menos acertiva com relação a isso, o que fez mais sentido para mim. O que eu gostaria de saber é quais seriam suas próximas apostas, quais seriam os próximos fatores de transcrição que vocês pensariam que estariam interagindo com PALB2? Obrigada!
11/04/2020
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