CARACTERIZAÇÃO GENÔMICA E PROPRIEDADES PROBIÓTICAS DE Limosilactobacillus fermentum JAC231

INTRODUÇÃO: Linhagens de Limosilactobacillus fermentum são conhecidas por suas propriedades probióticas, e têm sido estudadas por auxiliar na manutenção da função da barreira epitelial, realizarem exclusão competitiva e possuírem efeitos antimicrobianos para o tratamento de diversas patologias infecciosas, tais como as dos tratos gastrointestinal e vaginal. Além de oferecer efeitos benéficos ao hospedeiro, para ser considerado um probiótico, o microrganismo deve ser preferencialmente de origem humana, seguro e livre de vetores capazes de transferir genes de resistência, dos fatores de patogenicidade e toxicidade, além de capacidade de sobrevivência em condições intestinais. Este estudo objetivou realizar a caracterização genômica e as propriedades probióticas de um novo isolado vaginal de L. fermentum JAC 231. MÉTODOS: Foi realizado o sequenciamento do genoma da bactéria, bem como a identificação e análise das sequências codificadoras de peptídeos usando a RAST, pesquisa de proteínas ortólogas comuns entre diferentes linhagens da mesma espécie (MCC 2760, AGR 1485, ATCC 23271, CECT 5716, e IFO 3956) usando o Orthovenn3. A análise de genes relacionados à patogenicidade, virulência, resistência aos antimicrobianos e a presença de plasmídeos foi realizada com as ferramentas RAST, PlasmidFinder, PathogenFinder, VirulenceFinder, PathogenFinder, ResFinder e CARD v. RGI 5.1.0. A presença de sequencias CRISPR-CAs foi investigada pelo programa CRISPRfinder. Foram determinados a tolerância às condições gastrointestinais (pH, sais biliares e adesão a mucina) e o perfil de susceptibilidade a antibióticos. RESULTADOS: A análise pelo RAST mostrou a presença de 2.193 sequências codificadoras de proteínas, distribuídas em 220 subsistemas. A ferramenta OrthoVenn3 demonstrou que as linhagens analisadas formaram 2.257 clusters gênicos, dos quais 1.045 são ortólogos. Também foi observado que L. fermentum JAC 231 compartilha 1.228 agrupamentos ortológos com os outros probióticos. A análise de bioinformática identificou a presença de genes de resistência intrínseca aos glicopeptídeos e duas sequências de codificação para sequências CRISPR-Cas. L. fermentum JAC 231 foi suscetível à maioria dos antibióticos testados, boa tolerabilidade ao pH ácido e sais biliares, além de uma ótima capacidade de ligação a mucina. CONCLUSÃO: Este estudo revelou que L. fermentum JAC 231 possui características que preenchem os critérios para o uso potencial dessa linhagem como probiótico.