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Introdução: Fusarium spp. são fungos filamentosos amplamente distribuídos na natureza como saprófitos do solo. Sabe-se que esses fungos causam infecções em imunocomprometidos, contudo muitos estudos relatam a frequência de micoses causada por esses em imunocompetentes. Em indivíduos saudáveis este agente pode causar onicomicose e queratite. Por contraste, fusariose disseminada afeta o hospedeiro com deficiência imune, sendo freqüentemente fatal. O diagnóstico compreende no exame micológico direto juntamente com a cultura. Métodos biológicos moleculares, baseados na identificação do DNA fúngico com o uso de primers específicos também têm sido aplicados. Contudo a determinação desses agentes ainda não é otimizada. Sendo assim, o foco do trabalho é o poder discriminativo da espectroscopia fotoacústica para a detecção de diferenças espécies de Fusarium spp. aplicadas ao diagnóstico micológico. Métodos: Os espectros foram realizados através do Fourier Transform Infrared Photoacustic Spectroscopy (FTIR-PAS) feitos a partir das culturas puras suspensas em Sabouraud Dextrose Broth (SDB) e os resultados apresentados em gráficos. Resultados: Os resultados mostram que no mesmo comprimento de onda (300 nm) há diferenças no tipo de banda entre as espécies Fusarium solani, Fusarium oxysporum e Fusarium subglutinans. Essas diferenças entre bandas são possível pois as espécies apresentam microconídios e macroconídios distintos. Conclusões: Conclui-se que os fungos podem ser distinguidos especificamente por essa espectroscopia e assim, pode-se aplicar essa técnica a diferenciação e diagnóstico de micoses.