Análise in silico do Gene LTP (Lipid Transfer Protein) sob condições de Estresse Abiótico

Introdução: Sabe-se que o rendimento das culturas é influenciado negativamente por um grande número de fatores ambientais. As respostas de plantas ao estresse abiótico são muitas vezes complexas, por isso, nos últimos anos, muito se tem feito para isolar genes induzidos durante o déficit hídrico, a fim de estudar a função de produtos gênicos e os caminhos que conduzem à indução. Analisar in silico a expressão de genes pode contribuir de forma expressiva para elucidar as rotas de defesa das plantas, contribuindo sobremaneira para o melhoramento da cultura. O estudo teve como objetivo compreender in silico a relação da proteína LTP (Lipid Transfer Protein) e a tolerância ao estresse por seca. Métodos: A sequência do gene LTP foi adquirida no BCCCenter e o sequenciamento foi realizado para confirmação e caracterização da molécula de interesse. A análise in silico foi realizada mediante utilização dos softwares de bioinformática BlastX, Bioedit, Pfam 30.0, SMART, CFSSP, Aramemnon 8.1. Resultados: O sequenciamento resultou em mais de 1200 bp, com o frame 1 (+) apresentando o domínio da proteína, que contempla proteínas de transferência lipídica. É classificada no clã protéico da prolamina. A estrutura secundária da proteína compreende em grande parte folhas beta (79), seguido por hélices alfa (50). De acordo com o “software Aramemnon” a expressão do gene LTP (indução) em Arabidopsis na condição de estresse osmótico (seca) acontece por toda a planta, incluindo sistema radicular, hipocótilo e folhas, com indução máxima para os tempos analisados em 12 e 24 horas. Conclusões: Verifica-se a presença da proteína LTP em condições de estresse por seca, possivelmente relacionando-se a transferência de lipídios para a contribuição da tolerância das plantas ao estresse.