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A epistasia é a capacidade de um alelo de um determinado loco interagir com os alelos de loci diferentes. Apesar de importante ela ainda é, por vezes, negligenciada nos programas de melhoramento, visto sua complexidade e pela experimentação dispendiosa para prover informações sobre sua magnitude e ação no controle gênico dos caracteres. O trabalho buscou averiguar se a epistasia (previamente simulada) tem efeito importante no melhoramento genético de plantas. Utilizou-se nove características quantitativas, contínuas, com distribuição normal, média e variância conhecidas e herdabilidade com valores de 30, 50 e 70%. Elas foram estabelecidas pela ação de alelos de 50 loci, tomados ao acaso entre 1000 previamente genotipados, com efeito aditivo diferencial e pesos da importância do loco sobre a variabilidade genotípica total do caráter, estabelecidos a partir de uma distribuição binomial e grau médio de dominância de 0,5. Para estimar o efeito epistático três modelos foram utilizados. Um aditivo-dominante (modelo 1), um que leva em consideração os efeitos epistáticos de maneira acentuada (modelo 2) e um que considera os efeitos epistáticos entre pares consecutivos de genes (modelo 3). As herdabilidades estimadas foram coerentes, pois as discrepâncias entre valores estabelecidos e estimados são esperadas. Em características em que a epistasia não se manifestava em 50 loci gênicos, a análise de geração apontou a suficiência do modelo 1, e onde se pressupôs a ação epistática, ela também foi eficaz em apontar a importância da epistasia sobre a variação fenotípica das médias das gerações. O modelo 1 não calculou os efeitos de dominância de maneira correta, pois ele não considera os efeitos epistáticos, que estavam presentes. Os modelos 2 e 3 conseguiram captar os efeitos epistáticos de maneira correta, sendo que o modelo 2 mostrou resultados mais precisos que o 3, o que já era esperado. O método estatístico de análise gerações foi empregado para captar e quantificar, comparativamente, a importância da epistasia sobre características e conclui ser eficaz na detecção e quantificação da importância da epistasia sobre a variação fenotípica das médias das gerações estudadas.
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