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A identificação de grupos heteróticos em programas de melhoramento de milho é essencial para o desenvolvimento de híbridos superiores. Objetivou-se nesse trabalho alocar linhagens de milho tropical em grupos heteróticos com base em marcadores SNP (Single Nucleotide Polymorphism) e estimativas de capacidade de combinação. As 20 linhagens de milho tropical foram cruzadas em esquema de dialelo completo, e os 190 híbridos simples foram avaliados em dois ambientes contrastantes em níveis de nitrogênio: níveis normais (AN) e níveis baixos (BN). Utilizou-se o delineamento de blocos incompletos, com duas repetições, e avaliou-se a produtividade de grãos. Realizou-se análises dialélicas individuais. As linhagens foram genotipadas com marcadores moleculares do tipo SNPs, e utilizou-se 3.083 SNPs para o estudo de diversidade genética. Construiu-se os dendrogramas pelo método UPGMA, com base na capacidade específica de combinação (CEC) e na distância de Roger com base nos marcadores. A CEC foi significativa (P<0,01) para PG nos dois ambientes. As estimativas dos efeitos de CEC agruparam as linhagens em 4 e 3 grupos para BN e AN, respectivamente, enquanto os marcadores as alocaram em 3 grupos. Portanto, esses resultados serão úteis para explorar a heterose entre os grupos de linhagens, desenvolver populações de melhoramento e orientar futuros cruzamentos.
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