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Os morcegos pertencem a ordem Chiroptera, são classificados em duas subordens Yinpterochiroptera e Yangochiroptera, esta última compreendendo a família Phyllostomidae que é a mais diversificada apresentando 60 gêneros e mais de 200 espécies. Dentre os gêneros da família Phyllostomidae está o gênero Carollia, no Brasil, é representado por três espécies, a saber: Carollia perspicillata (Linnaeus, 1758); Carollia brevicauda (Schinz, 1821) e Carollia benkeithi Solari & Baker, 2006. As espécies C. perspicillata e C. brevicauda são amplamente difundidas no Brasil, ocorrendo em simpatria ao longo da maior parte de sua distribuição, além disso suas identificações com base em caracteres morfológicos mostram sobreposição nos caracteres analisados necessitando assim do uso de outras ferramentas. Neste contexto, este estudo tem por objetivo estimar a variabilidade genética das espécies C. perspicillata e C. brevicauda a fim de revelar a diferença e/ou similaridade genética entre estas que são intrinsicamente complexas quanto a unidade específica. Para tanto foram realizadas coletas nos biomas Amazônia, Cerrado e Caatinga com o uso de rede de neblina, sendo coletados 88 espécimes do gênero Carollia. Foi extraído DNA total a partir do tecido muscular, isolado e amplificado os genes mitocondriais Citocromo C Oxidase Subunidade I (COI) e RNA ribossomal 16S (rRNA 16S) via Reação em Cadeia da Polimerase (PCR), os produtos positivos das PCRs foram sequenciados e as sequências de DNA foram analisadas em vários softwares, a saber: Bioedit, MEGA X, DnaSP 5 e nas plataformas BLAST e BOLD Systems. Foram analisadas nove características morfológicas: coloração da pelagem, dentição, peso, medidas dos antebraços direito (Ant D) e esquerdo (Ant E), cauda (C), trago (T), orelha (O), pé (P), as medidas foram expressas em milímetros, sendo efetuadas com a utilização de paquímetro universal analógico manual 150mm e como resultado da análise morfológica verificou-se sobreposição entre as espécies analisadas, exceto para a característica dentição em que o 2º incisivo para alguns espécimes está encoberto pelo cíngulo e para outros espécimes o 2º incisivo não está encoberto por essa estrutura. A análise genética para o gene rRNA 16S a partir de 88 sequências com 649 pb revelou 28 haplótipos, 29 sítios polimórficos, distância genética máxima alcançada 2,18%, árvores filogenéticas de Agrupamento de Vizinhos (NJ) e Máxima Verossimilhança (ML) formando um único clado bem suportado. Para o gene COI, de 30 sequências analisadas com 526 pb obteve-se 21 haplótipos, 34 sítios polimórficos, distância genética máxima alcançada de apenas 2,57%, árvores filogenéticas mostraram a formação de apenas um clado fortemente suportado (100% de bootstrap). Neste sentido, os resultados deste estudo revelaram sobreposição nas medidas morfológicas, variabilidade genética muito baixa apontando para a não diferenciação específica, portanto para apenas uma unidade taxonômica Carollia perspicillata.
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