Estudo da estrutura tridimensional de peptídeos zíperes de triptofano através de cálculos de deslocamentos químicos de ¹H e simulações de Dinâmica Molecular
Detalhes
- Tipo de apresentação: Apresentação de Pôster / Poster Communications
- Eixo temático: Dinâmica Molecular
- Palavras chaves: dinâmica molecular; proteínas; Ressonância Magnética Nuclear;
- 1 Departamento de Química Orgânica / Instituto de Química / Universidade Federal Fluminense
- 2 Instituto de Química / Universidade Federal Fluminense
Estudo da estrutura tridimensional de peptídeos zíperes de triptofano através de cálculos de deslocamentos químicos de ¹H e simulações de Dinâmica Molecular
Ana Carolina Ferreira de Albuquerque
Departamento de Química Orgânica / Instituto de Química / Universidade Federal Fluminense
Resumo
Análise de estruturas tridimensionais de peptídeos.
Foram realizados cálculos de deslocamentos químicos e simulações de Dinâmica Molecular.
Identificação de elementos de estruturas terciárias de peptídeos zíperes de triptofano.
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Ana Carolina Ferreira de Albuquerque
Boa tarde, Willian. Agradeço imensamente seus comentários. Para este trabalho, fizemos um estudo de benchmarking, para análise dos melhores níveis de teoria para representação dos deslocamentos químicos experimentais, aliados a um baixo custo computacional. Ao final desta etapa, tivemos como resultado que o nível HF/3-21G apresentou uma reprodução satisfatória dos dados experimentais, aliado a um custo computacional razoavelmente baixo. O custo computacional, em particular, foi um fator importante na nossa análise, uma vez que o objetivo do projeto é expandir os cálculos para outras estruturas de peptídeos e proteínas de maior peso molecular. Quanto aos diferentes tipos de volta-beta, nosso estudo mostra que o protocolo de cálculos usado é eficiente na determinação do tipo de volta-beta. Estudos indicam que a formação de diferentes tipos de volta-beta é uma etapa importante no enovelamento da estrutura proteica. Além disso, a presença de diferentes tipos de volta-beta em proteínas de superfície parece ter um papel em diferentes processos de reconhecimento molecular com receptores e substratos (BMC Bioinformatics, 2010, 11:407). Assim, a predição do tipo de volta-beta em uma estrutura proteica é importante para o estudo do seu processo de enovelamento e para sua determinação estrutural. Obrigada!