Caro Emanuel,

Talvez este trabalho possa lhe interessar:  JPC C (2017), 121, 1295.

Um abraço.

Marco Chaer

Parabéns, Emanuel! Tópico bastante interessante. Uma duvida técnica: No caso da interação com o Zn, você usou parâmetros do campo de força (LJ12-6 + qq) que voces mesmo ajustaram? Notei uma alta coordenação do Zn. Chegaram a verificar se em nivel DFT esta coordenação se verifica? Obrigado.

Boa tarde, Emanuel,

Primeiro, parabéns pelo excelente trabalho e apresentação. Tenho algumas questões:

1) A estrutura do MOF foi previamente otimizada? Se sim, qual foi o método empregado?

2) Como é dada a energia potencial entre o MOF e as moléculas de adsorbato? 

3) Durante a evolução da dinâmica, é permitido que a estrutura do MOF se modifique ou ela é mantida rígida?

Att 

Hi Emanuel, excellent work.

Is CO2 concentration close to MOF ZIF-78 maximum when a 1:9 ratio is used for CO2-H2O blending? Have other similar proportions been tested?

Best,
Lucas

Congratulations for your work. 

Olá Eduardo, boa tarde. Parabéns pelo trabalho.

Achei interessante os resultados de adsorção e gostaria de saber se vocês pretendem modificar a estrutura química do ZIF-78 para aumentar a capacidade de adsorção de CO2 desidratado e na presença de água também?

Pt adsorption in Borophene nanosheet for sensor gas: a density functional theory

Caroline Jaskulski Rupp, Jonas Anversa, Rogério Baierle,

Bom trabalho,  parabéns, mas esses resultados não seriam os esperados?

Marco Chaer

Prezada Jéssica

Parabéns pelo seu trabalho!!!

Por favor, eu tenho algumas curiosidades:

1) Quantas moléculas você usou para construir uma micela?

2) Uma micela não existe isolada num meio líquido, ou seja, há um solvente ao redor da micela que, por sua vez, também rodeia o ânion. Você estudou o efeito do solvente neste processo de adsorção?

Obrigado por sua atenção

Eduardo

oi Jéssica! Parabéns pelo seu trabalho. Fiquei curioso sobre a cinética de adsorção/desorção dos íons nas micelas. É possível extrair informações sobre o tempo de residência dos íons nas micelas? Seria uma propriedade importante a ser calculada?

Boa tarde, Jéssica!

Comparando as duas micelas, há uma diferença entre o total de ânions adsorvidas por elas? Ou seja, considerando um mesmo ânion, há maior adsorção com um surfactante ou com o outro?

Além disso, ambas as micelas tem a mesma quantidade de surfactante ou não?

Grato,

Kalil

Olá Jéssica, parabéns pelo trabalho!

Como muda a estrutura da micela de HPE na presença de Fluoreto? E de HPC na presença de perclorato?

Obrigada!

Paula

Olá Willian, parabéns pela apresentação e pelo trabalho! Vocês chegaram a analisar a interação das cavidades obtidas com algum possível interferente? E uma curiosidade: qual o tempo médio para terminar uma dessas dinâmicas?

Olá,

assistindo sua apresentação, fiquei na dúvida se existe alguma evidência experimental que corrobora com sua observação que a representação por decâmero ao invés de monômero faz diferença na síntese.

Além disso, como vocês chegaram na escolha de decâmero, ao invés de outra configuração, como hexamero, octametro ou outro qualquer.

Prezado, parabéns pelo trabalho.

1) Vocês usam mecânica molecular para fazer as dinâmicas, certo? Qual campo de força vocês usaram?

2) Vocês desenvolveram algum programa para coletar dados, realizar as análises ou outros?

3) É possível comparar algum dado da MD de voês com dados experimentais? Se sim, e se há dados experimentais disponíveis, qual(is)? 

Olá, Vinícius, tudo bem? Parabéns pelo trabalho e pela apresentação!

Você poderia comentar rapidamente sobre as integrais de Kirkwood-Buff? Você calcula elas após as simulações ou é um cálculo separado?

Não seriam apenas integrais de g(r), como um número de coordenação, certo? Obrigado e um abraço!

Parabéns pelo excelente trabalho!

1) Por favor, qual método vocês usaram (DFT, Campo de Força, etc) para realizar as dinâmicas?

2) Como a MD foi feita na escala de "ns", eu assumo que seja campo de força, certo? Se sim, uma curiosidade..., você saberia dizer se esse campo de força é disponível gratuitamente ou é comercial?

3) Vocês desenvolveram algum programa para realizar as análises e obter as propriedades da MD?

Obrigado!

Olá Mariana! Primeiramente, parabéns, a você e à equipel, pela excelente apresentação e pelo belo trabalho! 

Eu fiquei curioso com relação à mistura de solvente água+etanol. Por que vocês simularam nessa mistura de solvente e não apenas em água? Os cálculos MM/GBSA também foram feitos considerando a mistura de solventes?

Um abraço e obrigado!

Prezada Brenda,

Parabéns pela apresentação/trabalho.

O \epsilon_0 refere-se a interação entre metal-água, certo?

A platina é muito polarizável ? Vocês pensaram em utilizar/verificar teus resultados usando um campo de força polarizável? 

Um abraço,

Olá, Brenda. 

Primeiramente, parabéns pelo trabalho. Abordagem muito elegante. 

Brenda, seus resultados mostram claramente que o tipo de superfície (principalmente do ponto de vista topológico) é fundamental para o mecanismo de adsorção. Uma maneira direta de relacionar uma quantidade termodinâmica com um parâmetro estrutural (área nesse caso) é através da "Tensão Superficial"(Energia Livre de Gibbs por Área). Assim, minha pergunta é: vocês conseguem calcular tensão superficial levando em conta a natureza topológica da superfície ?. Se sim, talvez essa quantidade torne ainda mais claro a interpretação dos diferentes regimes de adsorção que vocês estão observando.  

Parabéns pelo trabalho, Brenda!

Muito interessante e gostei bastante da qualidade dos seus slides e imagens!

Sobre possíveis efeitos que poderia estudar em uma possível continuação desse trabalho, pode ser interessante introduzir polarizabilidade explicita sobre o metal. Aqui tem um exemplo de campo de força polarizável que poderia utilizar: https://www.nature.com/articles/s41467-018-03137-8

Eu acredito que suas conclusões não serão qualitativamente afetadas, porém a polarizabilidade pode ter efeitos que mudar o epsilon não tem, como afetar a orientação preferencial da água devido a interações eletrostáticas.. Seria algo interessante de verificar.

Boa tarde Brenda,

Parabéns pelo trabalho e excelente apresentação.

Tenho duas dúvidas:

1ª. Além do TIP3, você usou outro campo de força?

2ª. Qual a aplicação direta você sugere para seu trabalho?

Muito obrigada.

Parabéns pelo trabalho, Leandro! Você foi muito didático e os resultados são muito interessantes!

Minha questão é com relação aos íons OH- e H3O+, pois sabe-se que a difusão dos mesmos em água não se dá de modo convencional mas sim pela transferência de próton entre moléculas de água, o que por sua vez envolve efeitos intrinsecamente quânticos. Poderia comentar sobre como isso poderia afetar os resultados para esses dois íons?

Grato,

Kalil

Boa tarde Laís,

Poderia detalhar um pouco como foi feito o pós-processamento com o MBAR? Fiquei em dúvida com seu gráfico de resultados preliminares. Os pontos cheios seriam resultados diretos de simulações e a curva azul o MBAR. No caso então, o MBAR teve como função ajustar essa curva para determinar o ponto crítico?

Grato,

Kalil

Olá Samantha! Parabéns pelo trabalho. O tema é bastante relevante e a modelagem computacional desempenha um papel importante na pesquisa. Você fala que a parametrização das cargas foi com o método PM7 e uso do programa MKTOP, que deriva topologias para o campo de força GROMOS, certo? Você também cita que usa o modelo TIP3P para a água. O modelo TIP3P é compatível com o campo de força GROMOS?

oi Jessé! Parabéns pelo trabalho. Vocês utilizam algum tipo de protocolo de equilibração mais detalhado antes da etapa NpT para um sistema tão carregado como esse? Em caso afirmativo, poderia detalhar?

Olá, excelente trabalho.
Os parâmetros de Temperatura, pressão e densidade no ponto crítico são os mesmos independente do sistema halógeno usado?

Obrigado.
Att. Lucas

Olá Brenda, muito interessante esse trabalho! Aprendi algumas coisas com ele :)
Como sugestao, eu acho que seria importante voce ter definido o que significa o epsilon, já que usou ele relativamente bastantena discussão.
No decorrer do vídeo eu entendi que seria um parametro do campo de força. Esse parametro está relacionado com a interaçao agua-superficie? ou água-agua?

Boa tarde Vinícius!

Bem interessante seu trabalho! Tenho uma pergunta referente mais sobre a proteína em si. Devido à diferente agregação de íons, houve mudanças na conformação da proteína? Alias, com relação ao tempo de simulação, você considera que 10 ns seria suficiente para observar tais mudanças caso ocorram?

Penso que, como na mistura a concentração total de íons é maior, isso poderia levar a um efeito "salting out" ou algum outro tipo de mudança de conformação e isso pode ser pelo menos parte da explicação de porque a presença de um LI resulta num aumento na adsorção do outro.

Grato,

Kalil

Olá, Tainah! Parabéns a você e equipe pelo trabalho, pela excelente apresentação e pelos ótimos slides!

Fiquei só com uma dúvida ao assistir seu vídeo:

Você comentou que os parâmetros de Lennard-Jones foram obtidos do GAFF, exceto os do vanádio. Vocês chegaram a fazer cálculos para obter L-J do vanádio? se sim, como foi esse cálculo? ou obtiveram de outras fontes? Um abraço e obrigado!

Olá Samantha!

Parabéns pela sua apresentação.

Poderíamos dizer que os dois polímeros têm seletividade para diferentes agroquímicos? A energia livre de interação poderia ser utilizada como diretriz para otimizar estruturas poliméricas (como mudar a composição) para ser mais seletivo com relação a uma espécie química?

Seria interessante também descrever as interações responsáveis pela maior ou menor interação polímero-agroquímico.

Abraços

Paula

Parabéns Vinícius pelo trabalho!

Além dos picos de MDDFs, você conseguiu avaliar as contribuições energéticas das interações, avaliar a energia livre de solvatação da proteína nos LIs?

Obrigada!

Paula

Olá, Jéssica! Tudo bem? Parabéns pelo trabalho. Gostaria de perguntá-la um curiosidade. Você tem ideia de qual(is) indústria(s), instalada(s) em nosso país ou de fora, que poderia(m) se beneficiar desse melhor entendimento da adsorção de ânios na interface micela-solução?