Anais do Simpósio Brasileiro de Química Teórica
Proceedings of the XXI Brazilian Symposium on Theoretical Chemistry - Vol. 1 2021

Boa tarde, Rebeca. Parabéns pelo trabalho.

Como você escolheu o funcional e o conjunto bases?

Prezado Alberto, 

Primeiramente, parabens pelo seu trabalho e pela desenvoltura com a lingua inglesa. Gostaria de questionar a voce qual (is) seriam os principais desafios para realizar esses mesmos calculos com moleculas contendo 3 ou mais atomos. 

Ola Alex, boa tarde !

Gostaria que explicasse o motivo de ter escolhido o nivel de calculo 6-31G(d), ao inves do 6-31G(d,p) como e comumente trabalhado na literatura. Na sua apresentacao parece que os calculos foram realizados no "meio vacuo". Caso positivo, nao seria interessante investir no "custo computacional" do uso do meio solvente ?

Obrigado. Parabens pelo trabalho  

Olá, Gustavo!
Parabéns pelo seu trabalho. É bastante interessante. Essas estruturas "dipolares" frequentemente possuem alto caráter simpleto-birradicalar. 

Por qual razão vocês escolheram trabalhar com o método computacional que escolheram? O custo computacional/tempo de cálculo é muito longo? Você verificou outros métodos possíveis?

Prezado Alex, Gostaria de tirar algumas dúvidas que estão listadas a baixo: 1) Nesse trabalho vocês só realizam somente cálculos de DFT? Os cálculos foram feito em vácuo ou usando algum método de solvatação?  2) Vocês pretendem utilizar cálculos de dinâmica molecular para comprovar os resultados de vocês? Sinceramente não acredito que somente através dos indices de Fukui e cálculos de DFT (feitos no estado fundamental) sejam eficientes para identificar bons inibidores para vírus e outras doenças. 3) Uma dica para aprimorar seu trabalho e obter resultados mais sólidos é realizar uma dinâmica molecular para cada uma das moléculas citadas no seu trabalho usando junto a uma proteina do Sar-Cov-2 como receptor. Dessa maneira você poderia realizar a análise mostrada em seu trabalho para conformações especificas devido a interação proteina molécula. Vale resaltar que a densidade eletrônica depende da conformação da suas moléculas dessa maneira os indices de fuikui apresentados no seu trabalho também irão mudar.   

Olá Gabriel, não ficou claro como os modelos dos sólidos foram construídos e validados. Por que não utilizar métodos com condições periódicas de contorno (PBC)? Além disso, para o estudo da atividade catalítica, seria preciso validar esses índices comparando com um estudo cinético explícito, ou seja, com a busca dos caminhos de reação e estados de transição. Isso foi ou será feito?

Ola Rebeca, parabens pela apresentacao.

Apenas duas pergntinhas:

- Voces fizeram alguma analise comparativa com resultados experimentais?

- Quais seriam as proximas etapas de seu trabalho?

Olá Gustavo! Parabéns pelo trabalho. Está tudo muito bem executado e explicado. Eu tenho algumas perguntas sobre a metodologia: como foi escolhido o nível de teoria utilizado no trabalho? Qual a razão de utilizar o modelo SMD?

Boa tarde, Hugo. Parabéns pelo trabalho!

Você chegou a avaliar quão importante seria considerar o movimento vibracional da sua molécula de Li dentro da cavidade? Um confinamento em uma região cada vez mais restrita não poderia levar a uma elevação abrupta da energia vibracional do sistema com a tendência de tirá-lo cada vez mais da posição de equilíbrio?

Obrigado!

Boa tarde, Rebeca. Parabéns pelo trabalho!

Você pegou os parâmetros geométricos de algum lugar para fornecer sua estrutura inicial para o cálculo? Por que você escolheu o funcional B3LYP? Você chegou a testar outros funcionais?

Você encontrou outros trabalhos na literatura com abordagens computacionais ao Xanthohumol? Se sim, a metodologia usada era parecida com a sua? Como os seus resultados se comparam aos existentes na literatura? Você comparou o espectro IV que obteve especificamente com o espectro experimental do Xanthohumol? Tudo isso pode ser um bom indicativo da adequação do funcional que você escolheu para as propriedades que você quer estudar sobre este composto.

Obrigado!

Primeiramente, Parabéns João, ótimo trabalho!

Eu queria saber por que foram escolhidos apenas (eu pelo menos entendi isso...) orbitais do V nos seus cálculos para formar o espaço ativo? Os orbitais do Ar ou Kr estão em mais baixa energia de modo que incluí-los no espaço ativo não se faz necessário?

Oi Hugo, uma coisa que não ficou clara para mim é o seguinte: quando você aumenta o R, isto é, a distância internuclear, o seu confinamento aumenta também, certo? Então é um confinamento que não confina completamente a molécula, pois ele varia, isso é certo?

Ola Ellen, primeiramente parabens pelo seu trabalho. 

Quando voce escolheu trabalhar com o fluor, vc tinha alguma indicio experimental de que esse elemento seria um dopante adequado ao seu proposito? Quando comecei a assistir a sua apresentacao achei a alta eletronegatividade dele poderia interferir nos processos de transferencia de carga no interior da estrutura e afetar o bandgap do solido ... fato que acabou se consolidando. POderia explicar melhor essa escolha ? Obrigado  

Oi Hugo, tudo bem? Legal o trabalho. Gostaria de saber como que a sua curva de energia potencial para o limite sem confinamento se compara com um cálculo tradicional com bases gaussianas. É proximo? Seria compatível com qual tipo de função de bases?

Olá Gustavo,

Parabéns pelo trabalho! Você é aluno de iniciação científica?

O SMD pode influenciar os seus resultados (isto é, seu perfil de energia final)?  Você pensaram em incluir água explicita na modelagem?

Obrigado

Gostei desse trabalho, meus parabêns muito bem explicado.. Gostaria de perguntar, será que esse aumento no band gap vai ser igual para as tres fases: cúbica, tetraédrica e ortorrombica? você trabalhou com qual fase? E como essa correcção para o vdW tambẽm foi visto o mesmo efeito do F?

Boa tarde, David. Parabéns pelo seu trabalho!

Acho essa maneira de interpretar a formação de uma ligação química muito interessante. Se já estão aplicando este conceito para elementos do bloco d, imagino que já testaram bastante em sistemas mais simples. Esse modelo tem sido consistente na previsão da formação e das energias/forças de ligação dos diversos "tipos" de ligação que podem ser formadas pela tabela periódica? Quero dizer, ele é aplicado essencialmente da mesma forma? Qual seria o gargalo até agora?

Obrigado!

Gostei muito do seu trabalho, mas não entendi o objetivo de se usar o mesmo método, com a mesma base em diferentes softwares, por exemplo MRCI no Columbus e Molpro. A princípio os resultados deveriam ser os mesmos. Qual o motivo desta escolha: a) Facilidade com os inputs?b) Falta de confiança na implementação dos métodos? Fale um pouco mais sobre isso.

Oi João, tudo bem? Você considerou a correlação dos orbitais do caroço, pelo menos do caroço mais externo (3s, 3p do V, e do Kr, 2s, 2p do Ar, acho)? Se não, será que isso melhoraria (ou pioraria) a comparação com os valores experimentais para o terceiro (ou segundo, respectivamente) canais?

Oi David, legal a abordagem. Não conheço esse método, então queria saber o seguinte: por que a função de onda GPF usa HF nos elétrons do caroço e GVB nos elétrons de valência? Como isso é feito? Seria possível usar apenas um deles, ou CASSCF, por exemplo?

Gostei muito do seu trabalho, mas não entendi o objetivo de se usar o mesmo método, com a mesma base em diferentes softwares, por exemplo MRCI no Columbus e Molpro. A princípio os resultados deveriam ser os mesmos. Qual o motivo desta escolha: a) Facilidade com os inputs?b) Falta de confiança na implementação dos métodos? Fale um pouco mais sobre isso.

Olá, Alex! Tudo bem? Uma curiosidade sobre o seu trabalho é: qual o efeito da interação dos fármacos investigados com as bases nitrogenadas que justificam o emprego no tratamento da COVID-19? Uma outra curiosidade é se vocês pretendem fazer uma correlação entre as energias de interação dos fármacos com as bases nitrogenadas com as informações de reatividade (de maciez química) avaliadas.

Nice presentation indeed! I was wondering if switching from CISD to QCISD should improve the results. I believe the curve for QCISD (as it has the quadratic term) would be very close to the CCSD curve, or at least closer to CCSD than to CISD. Did you (or will you) test this?