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Caio Oliveira da Silva and 1 other person replied to the topic "Vários"

Publication: How to use geometry to optimise the Hartree-Fock wave function

Prezado Caio,   Achei bastante interessante o seu trabalho. Gostaria de fazer alguns comentários e perguntas. Primeiramente, achei estranho você dizer que não conseguiu convergir o "SCF puro" para a água. Eu já fiz esse cálculo várias vezes e nunca tive problema de convergência.  Já usei métodos de otimização global para átomos, mas nunca para moléculas. Existe alguma relação entre o seu método e métodos de otimização global? Posso lhe mandar um artigo se lhe interessar. A função determinante de Slater, embora a forma mais usual de função de onda teste, por sua utilização em métodos Hartree-Fock e DFT, não tem a forma correta para tratamento de sistemas polieletrônicos. As funções DS não respeitam a simetria de permutação do hamiltoniano polieletrônico, ou seja, não são base para o grupo simétrico, como deveriam ser. Posso lhe mandar um artigo se interessar. Teria como usar métodos de geometria diferencial para otimizar funções de onda que são bases para o grupo simétrico?  
11/12/2021
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Igor Araujo Lins replied to the topic "Comparações entre mecanismos e métodos"

Publication: Oxidação da ciclopentanona: um estudo mecanístico

Olá Igor. Parabéns pelo trabalho. Acredito que é importante avaliar se existem outros mecanismos relacionados a decomposição da ciclopentanona, inclusive com outros métodos e quanto a sua proposta tem mais vantagens do que as demais. Senti falta de uma comparações entre isto. A minha sugestão é que, se possível, faça esta análise, principalmente para saber se o que você esta propondo termodinamicamente e cineticamente viável em relação aos demais. Maiores informações. Pastoors, J. I. M., Bodi, A., Hemberger, P., & Bouwman, J. "Dissociative Ionization and Thermal Decomposition of Cyclopentanone.", Chemistry - A European Journal, 2017, 23(53), 13131–13140.  http://dx.doi.org/10.1002/chem.201702376  Zaras, A. M., Thion, S., & Dagaut, P. "Computational Kinetic Study for the Unimolecular Decomposition of Cyclopentanone.", International Journal of Chemical Kinetics, 2015, 47(7), 439–446.  http://dx.doi.org/10.1002/kin.20921 Muito obrigado.
11/12/2021
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Felipe Willemann replied to the topic "Cargas do soluto"

Publication: Estudo teórico do efeito solvente em sondas fluorescentes

Olá Felipe, excelente apresentação. Eu tenho trabalhado com o GAFF e atualizado as cargas com CHelpG, mas ainda não apliquei para cálculo de absorção, apenas na parte estrutural. Minha dúvida é se a troca de cargas modifica a estrutura do soluto ou a interação do soluto com o solvente em torno. Já q vc possui as geometrias com cargas via GAFF e CHelpG, vc chegou a verificar se há mudanças na função de distribuição radial entre soluto e solvente? Sendo o soluto flexível, é complicado verificar diferenças estruturais nas duas simulações de cargas diferentes. Vc tem uma ideia de como comparar as estruturas do soluto para as simulações com cargas diferentes?   Sucesso.
11/12/2021
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Vinícius Bonatto replied to the topic "Comentário sobre o trabalho"

Publication: Intermolecular Covalent Interactions: A Unified Framework for Pnictogen-, Chalcogen-, Halogen-, and Hydrogen Bonds

Oi Lucas, ótima apresentação e trabalho bem relevante! Tenho muito interesse neste tópico, pois muitas vezes, ao propor novos inibidores (candidatos a fármacos) uma maneira interessante de alcançar seletividade frente a outros alvos, é explorando estes tipos de interações (principalmente, halogênio e calcogênio). Porém, no meu caso, para simular estes tipos de interações ao analisar complexo inibidor-enzima por dinâmica molecular, utilizamos um ponto extra de carga positiva para representar o sigma-hole, até hoje, não tivemos problemas com essa aproximação. Gostei bastante do trabalho feito por vocês, bem interessante. Parabéns!
11/12/2021
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Matheus de Oliveira Bispo replied to the topic "física dos funcionais"

Publication: Long Range Parameter Optimization For The Description Of Potential Energy Surfaces Using Density Functional Theory

Caro Matheus, parabéns peo trabalho!   Você utiliza funcionais bem diferentes, certo? Por exemplo, o wB97XD é híbrido e tem correção de dispersão, ao contrário do PBE   Ao otimizar o parâmetro de longo alcance você está corrigindo qual deficiência dos funcionais? Sempre a mesma deficiência em todos os casos? Os valores ótimos de w são semelhantes para diferentes funcionais?   Obrigado   Marcio
11/12/2021
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