Feed | Anais do XXI Simpósio Brasileiro de Quimica Teórica - Vol. 1 2021 | Galoá Proceedings

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Follow the main updates and discussions about the papers published in SBQT 2021!

All activities (50)

2 persons favorite the paper "Docking studies of naphthoquinones against SARS-CoV-2 main protease"

1 person favorite the paper "Reactivity of three different bioactive molecules through a density functional theory study"

1 person favorite the paper "Identificação de inibidores simultâneos de PARP1, Bcl-2 e Bcl-xL através de estudos computacionais"

1 person favorite the paper "Investigação teórica do mecanismo da reação de condensação de Knoevenagel entre compostos carbonílicos e malononitrilo."

2 persons favorite the paper "Docking de candidatos a fármacos na albumina do soro bovino."

2 persons favorite the paper "Estudo computacional por modelagem comparativa, docking molecular e previsão ADMET de alvos moleculares frente a protease esterol 14alfa-desmetilase do Trypanosoma cruzi"

1 person favorite the paper "Study of the interactions between Trypsin with BTCI derived molecules"

1 person favorite the paper "Reposicionamento de fármacos utilizando triagem virtual baseada em ligante, com interesse ao tratamento da Doença de Chagas"

1 person favorite the paper "Estudo de docking molecular e NCI das interações entre a Tacrina, ACh e a acetilcolinesterase humana."

Lucas Welington de Lima replied to the topic "Modelagem da folha de rGO"

Publication: Sarin-air mixture filtration by a porous rGO: a molecular dynamics study

Olá Marco, parabéns pela apresentação! Eu queria saber como vocês chegaram ao modelo utilizado para simular a folha de rGO? Pergunto isso porque há na literatura algumas metodologias para se oxidar o grafeno e depois reduzí-lo, porém, até o meio de 2018 (última vez que pesquisei sobre o tema) ainda existiam muitas dúvidas quanto à estrutura do rGO devido aos diferentes processos de síntese.

Tatiana Rossafa Pauletti and 4 other people replied to the topic "Distance to pure (non-entangled) states"

Publication: Entanglement measures for probing quantum phase transitions in superlattices

Hi Tatiana, interesting to see how these different entanglement measures relate to each other. I am aware that another way to measure entanglement is by calculating the distance from the state to the set of pure states (those with no entanglement). Do you know if this other measure can be used to detect phase transitions, or how it is related to the entropic measures you used?

ROBERTA OLIVEIRA and 2 other people replied to the topic "Outras formas de mensurar a força de ligação"

Publication: QUANTIFYING BOND STRENGTHS VIA A COULOMBIC FORCE MODEL: APPLICATION TO THE IMPACT SENSITIVITY OF NITROBENZENICS, NITROGEN-RICH NITROAZOLES AND NON-AROMATIC NITRAMINES MOLECULES

Parabéns pelo trabalho interessante e inovador. Vocês chegaram a avaliar outras formas de calcular a força da ligação? Vocês chegaram a avaliar se a inclusão da variável distância (R) da ligação alvo melhora o modelo linear que vocês ajustaram? Ou a participação do R na expressão de F já tornaria isso redundante?

Allan Pinto and 1 other person replied to the topic "SOC"

Publication: On the structural and electronic properties of BCN diamondene

Parabêns pela apresentação Allan, muito bem explicado .. Gostaria de perguntar, você testou somente pelo PBE??, será que se é utilizada uma correcão SOC esses gaps vão mudar muito ou não seria necesario ?

Lucas Freitas Feitosa and 1 other person replied to the topic "Máximos e mínimos da elipticidade"

Publication: QTAIM analysis of the [4+2] Diels-Alder Intrinsic Reaction Coordinate

Oi Lucas, tudo bem? Tem alguma interpretação para os pontos de máximo e mínimo na elipticidade (entre os carbonos 1 e 14), que aparecem no IRC em cerca de 15 e 30?

Tatiana Penna and 1 other person replied to the topic "Metodologia"

Publication: Solvation effects on the p-Aminobenzoic Acid Protonation Dynamics by Ab Initio Molecular Dynamics

Parabéns, Tatiana! Muita bacana o trabalho! Tenho algumas questões técnicas: Na simulação CP, usou qual tamanho de caixa (aresta) e densidade? Foi um tempo longo se simulação para calculos CP (220 ps). Quanto tempo levou e quantos núcleos alocou? Chegou a fazer alguma estimativa de energia de Gibbs?

Lucas Freitas Feitosa replied to the topic "Uso de outros descritores da QTAIM"

Publication: QTAIM analysis of the [4+2] Diels-Alder Intrinsic Reaction Coordinate

Olá, Lucas! Primeiramente parabéns pelo trabalho. Vocês chegaram analisar outros descritores da QTAIM como laplaciano, energias cinéticas e potencial nas diferentes etapas do IRC? Essa analise com outros descritores poderia fornecer algum resultado interessante?

1 person favorite the paper "Modelagem e análise comparativa entre as fosfomanoses isomerases humana e de Xanthomonas sp, para o desenvolvimento de inibidores contra o cancro cítrico."

Leonardo Duarte and 1 other person replied to the topic "Comentário"

Publication: Infrared intensities of imaginary frequencies: Gas-Phase SN2 Transition States

Parabéns pelo trabalho, Léo! Abraço p/ Bruns!

2 persons favorite the paper "ESTUDO TEÓRICO ENTRE PESTICIDAS ORGANOFOSFORADOS E ORGANOFOSFOTIOATOS E A ENZIMA ACETILCOLINESTERASE HUMANA (HssAChE)"

2 persons favorite the paper "Complex eIF4E- eIF4G Inhibitors for the Treatment of Autistic Spectrum Disorder: A theoretical study "

Leonardo Duarte and 1 other person replied to the topic "muito legal!"

Publication: Infrared intensities of imaginary frequencies: Gas-Phase SN2 Transition States

Muito interessante essa idéia Leonardo! Nunca havia parado pra pensar sobre isso. comentarios: - aos 03:28, qual unidade voce está usando para a frequencia? Voce disse qus são bem intensas, mas não entendi o que voce falou na hora que deu a unidade. - Sobre essa separacao que voce fez no grafico das contribuicoes C, CT, DP: Temos algo similar na estrutura de um minimo? ou seja: CT é dominante para as intensidades?

Leonardo Duarte replied to the topic "Sugestão para a investigação da Reação SN2"

Publication: Infrared intensities of imaginary frequencies: Gas-Phase SN2 Transition States

Olá Leonardo. Parabéns pelo trabalho. Contudo, estas reações SN2 tem dependência do solvente e acredito que seria um bom teste para teoria CCTDP tentar investigá-los pelos menos implicitamente. Dá uma olhada aqui: "Comparison of Free-Energy Methods to Calculate the Barriers for the Nucleophilic Substitution of Alkyl Halides by Hydroxide by Hafiz Saqib Ali, Jonathan Higham, Sam P. de Visser*, and Richard H. Henchman* Cite this: J. Phys. Chem. B 2020, 124, 31, 6835–6842 Publication Date:July 10, 2020 https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.0c02264 Acredito que seria importante avaliar isto também. Muito obrigado.

2 persons favorite the paper "QMMM transition path sampling study of serine hydrolase mechanism"

1 person favorite the paper "Analyzing the Trans Effect in Pt(II) Complexes from the Overlap Model Perspective"

João Bosco Paraiso da Silva and 1 other person replied to the topic "Análise numa série de reações"

Publication: Infrared intensities of imaginary frequencies: Gas-Phase SN2 Transition States

Leonardo, Parabéns pelo trabalho. Muito interessante. Permita-me uma pergunta: se o termo de fluxo-de-carga é relevante nas coordenadas de reação envolvidas no estado de transição, para uma série de diferentes reações imagino que deveria existir (me corrija se estiver errado), um aumento da intensidade desse modo em função do aumento da carga transferida. Você observou algo nesse sentido?

Yuri Alexandre Aoto replied to the topic "CISD vs CC"

Publication: A geometric interpretation for coupled-cluster theory being more accurate than corresponding configuration interaction

Caro Yuri, achei o trabalho muito interessante, não conhecia a abordagem Eu teria duas perguntas/curiosidades: 1) Não entendi o argumento de porque a excitação quádrupla, existente apenas no CC, pode ser descartada como explicação para seu melhor desempenho em relação ao CI 2) O quão difícil seria generalizar a abordagem para problemas de maior dimensionalidade? (maiores espaços ativos) Obrigado Marcio

Taináh Santos replied to the topic "Aplicação"

Publication: Development and validation of force field parameters for a vanadium complex from quantum mechanical calculations

Parabéns pelo trabalho e pela apresentação. Uma dúvida: Até que ponto a validação que vocês fizeram, que indicou excelentes resultados em comparação com QM e Exp, se estende para o caso do composto interagindo com o substrato biológico numa futura etapa de aplicação do campo de força desenvolvido por vocês?

Beatriz Costa Guedes replied to the topic "Energias degeneradas"

Publication: Estudo teórico da adsorção de metais alcalinos no grafeno

Pq o método PBE+D3-BJ torna as energias das configurações degeneradas? Para o sódio pq não tem a configuração Bridge?

Maurício Gustavo Rodrigues replied to the topic "Interessante"

Publication: Theoretical Studies on the Cellulose – Zwitterionic Drugs Interaction by Computational Simulations.

Olá, Júlio, tudo bem? Muito interessante seu trabalho e apresentação. Bem bacana. Não é exatamente uma pergunta pertinente, porém de interesse. Tens algum interesse prático na adsorção de drogas zwiteriônicas na celulose? Fiquei bastante interessado no porquê fazer essas contas, primeiro porque nem nunca vi nem nunca pensei nesse problema, segundo porque penso em algumas coisas parecidas com isso. É importante destacar que se a resposta for não, faça ainda mais essas contas, afinal tem um sistema de grande interesse e pouco desenvolvido. Obrigado, parabéns novamente.

Maurício Gustavo Rodrigues and 1 other person replied to the topic "Comentário"

Publication: An integral grid-based variational method applied to vibrational spectroscopy

Parabéns pelo trabalho pessoal, muito legal! Abraço p/ todos vocês!

Luiz Paulo Zidoi replied to the topic "função de base"

Publication: Molecular modeling for the interpretation of SERS of water contaminants: a case study for Diuron and Acephate

Excelente trabalho, meus parabéns, uma sugestão seria usar uma base como a def2tzv para comparar com os seus resultados.

2 persons favorite the paper "SiC monolayer as promising anode material for sodium-ion batteries"

Júlio Amando de Barros and 1 other person replied to the topic "Congratulations!"

Publication: Theoretical Studies on the Cellulose – Zwitterionic Drugs Interaction by Computational Simulations.

Parabéns pelo trabalho Julio! A Suíça é logo ali! Um abraço.

Eduardo Ribeiro Almeida and 1 other person replied to the topic "nanocontainer for cisplatin"

Publication: Carbon nanohorn as nanocontainer for cisplatin: insights on the interaction with plasma membranes of normal and breast cancer ce

Belo trabalho, Eduardo! Duas perguntas breves: a cisplatina é possivelmente o radio-sensibilizador mais utilzado, e creio que seja primordialmente utilizado sem encapsulamento 1) Qual(is) seria(m) as vantagens terapêuticas do encapsulamento 2) O encapslamento interfere na reatividade/ação radio-sensibilizadora da droga? Afeta, digamos, sua capacidade de formar complexos com DNA e/ou outras biomoléculas? Afeta sua eletroafinidade? Obrigado Marcio

Renaldo Moura Jr replied to the topic "grafeno x coroneno"

Publication: Interações entre folhas de grafeno pura e dopada e gases do efeito estufa sob a luz de métodos de análise de ligações

Muito interessante o trabalho, parabéns. Fiquei com dúvida se você iria mostrar algum resultado utilizando um modelo de grafeno periódico. Em todos os cálculos você usou uma molécula de coroneno para modelar o grafeno?

Leonardo Duarte replied to the topic "Dúvida"

Publication: Infrared intensities of imaginary frequencies: Gas-Phase SN2 Transition States

Olá Leonardo, Muito interessante seu trabalho, nunca tinha imaginado que havia essa relação do "caminho" de reação com a frequência de vibração. As animações ficaram muito legais mesmo, fica bem evidente os pontos que você mostrou. Fiquei com uma dúvida apenas: como que é determinado essa rota do ataque nucleofílico? Você otimiza uma geometria/configuração inicial e vai incrementando pequenos deslocamentos na direção da coordenada interna que minimiza a energia do sistema? Parabéns pelo trabalho e até mais (talvez nos vemos pelos corredores do bloco H ou pelo IQ). Pedro G. Faccin

5 persons favorite the paper "Long Range Parameter Optimization For The Description Of Potential Energy Surfaces Using Density Functional Theory"

Leonardo Duarte replied to the topic "Influência da "

Publication: Infrared intensities of imaginary frequencies: Gas-Phase SN2 Transition States

Oi, Leonardo! Muito interessante seu trabalho. Vocês chegaram a verificar como a massa influencia em suas análises?

Gabriel Barros Baptistella replied to the topic "Parabéns "

Publication: DFT studies of an oxalate-bridged oxidovanadium(IV) binuclear complex with an anti-diabetic activity

Parabéns pelo trabalho!

Eduardo Lemos de Sa replied to the topic "Sobre a metodologia de cálculo"

Publication: Brønsted Acid Catalyzed Methoxy to Hydroxy Rearrangements in Isoquinoline Coumpounds

Prezado Nelson Parabéns pelo seu trabalho!!! Eu tenho algumas curiosidades sobre a metodologia empregada. Por favor: 1) Por que você escolheu bases de Pople? Elas são bases all-electron mas, será que os perfis energéticos teriam mudados tanto se você tivesse usado bases ECP (uma tripla-zeta, por exemplo). 2) Você chegou a testar outros funcionais? O B3LYP, sem a correção de dispersão, produziu resultados muito diferentes? Obrigado por sua atenção Eduardo

1 person favorite the paper "Protein Solvation in ionic liquid mixtures"

1 person favorite the paper "Efeitos do 2,2,2-Trifluoroetanol no equilíbrio conformacional do peptídeo (AAQAA)3"

Luiz Paulo Zidoi and 1 other person replied to the topic "Gromacs"

Publication: Planejamento por Modelagem e Dinâmica Molecular de Polímeros Adsorsores de Pesticidas Organofosforados

Olá Samantha! Parabéns pela apresentação! Os softwares ACPYPE e MKTOP foram utilizados por você foi no sentido de poder "ler" as estruturas pré-otimizadas no Gromacs posteriormente?

Eduardo Ribeiro Almeida replied to the topic "Parabéns!"

Publication: Carbon nanohorn as nanocontainer for cisplatin: insights on the interaction with plasma membranes of normal and breast cancer ce

Parabéns pelo excelente trabalho.

Marionir Macedo Castelo Branco Neto and 4 other people replied to the topic "Metodologia"

Publication: Ab Initio Investigation of CO2 Reduction on Stepped Silver Surfaces

Prezado Marionir, Parabéns pela apresentação/trabalho. Qual programa vocês estão utilizando para o cálculo DFT? Você deixa a estrutura relaxar? Como vocês medem a adsorção nesse caso (uma questão geométrica ou energética? )? Calcularam a energia de adsorção? Obrigado.

Julio Chagas replied to the topic "Diferença no índice Al(vib)"

Publication: Substituent Effects on the Structure and Aromaticity of Benzene Derivatives: Special Cases

Olá Julio, parabéns pela apresentação e pelo trabalho. Eu percebi que o índice Al(vib) difere das tendências observadas com os demais índices para o X=CH3. Vocês investigaram o motivo dessa diferença? Vocês fizeram análises de população eletrônica, de orbitais moleculares ou NBO dessas moléculas? Talvez ajude a corroborar as suas conclusões finais.

Maicon Lourenço replied to the topic "Sobre o método MCQ"

Publication: Determinação de constantes espectroscópicas precisas para o sistema Li2 via Monte Carlo Quântico

Prezado, parabéns pelo trabalho. Algumas curiosidade sobre o método monte carlo (MC) que você trabalha. 1) O método MCQ atua em valores aleatórios da distância Li-Li e para cada valor você faz uma cálculso MCSCF? 2) Ou vocês usam o MCQ para obter os pesos dos determinantes presentes no método MCSCF? 3) Há perspectivas de ir para sistemas triatômicos, Li3? Obrigado!

Maicon Lourenço replied to the topic "Rede neural?"

Publication: Combinação de redes neurais e cálculo de deslocamento químico de RMN 1H e 13C como forma de avaliação estrutural do helianuol F

Parabéns pelo trabalho! 1) Vocês estão tentando obter, por meio de dados de RMN e modelagem, a conformação mais provável da molécula? 2) Por favor, a rede neural que vocês mencionam no trabalho foi usada para realizar regressão ou classificação? 3) Qual descritor vocês usaram para realizar o modelo de rede neural? Obrigado!

Rogério Baierle replied to the topic "Dúvida "

Publication: First principles investigation of Si-doped BC2N single layer for hydrogen storage and hydrogen evolution reaction (HER)

Prezado Rogério, parabéns pelo trabalho. Gostaria de saber qual a influência das bordas, defeitos e doping nesse tipo de sistema para uso em catalise?

Gustavo Gomes de Sousa replied to the topic "Sugestão"

Publication: Modelagem da interação do radical hidroxil com o 1,4-dioxano.

Parabéns pelo trabalho Gustavo! Na construção do perfil de energia (Figura 2) você utilizou energia eletrônica total ou energia livre? Fiquei curioso p/ saber quais as próximas reações/etapas que irá estudar! Mande um abraço ao Prof. Politi!