energética
Publication: Protein Solvation in ionic liquid mixtures
Parabéns Vinícius pelo trabalho!
Além dos picos de MDDFs, você conseguiu avaliar as contribuições energéticas das interações, avaliar a energia livre de solvatação da proteína nos LIs?
Obrigada!
Paula
Possíveis mudanças conformacionais do soluto?
Publication: Protein Solvation in ionic liquid mixtures
Boa tarde Vinícius!
Bem interessante seu trabalho! Tenho uma pergunta referente mais sobre a proteína em si. Devido à diferente agregação de íons, houve mudanças na conformação da proteína? Alias, com relação ao tempo de simulação, você considera que 10 ns seria suficiente para observar tais mudanças caso ocorram?
Penso que, como na mistura a concentração total de íons é maior, isso poderia levar a um efeito "salting out" ou algum outro tipo de mudança de conformação e isso pode ser pelo menos parte da explicação de porque a presença de um LI resulta num aumento na adsorção do outro.
Grato,
Kalil
Curiosidade sobre as integrais de Kirkwook-Buff
Publication: Protein Solvation in ionic liquid mixtures
Olá, Vinícius, tudo bem? Parabéns pelo trabalho e pela apresentação!
Você poderia comentar rapidamente sobre as integrais de Kirkwood-Buff? Você calcula elas após as simulações ou é um cálculo separado?
Não seriam apenas integrais de g(r), como um número de coordenação, certo? Obrigado e um abraço!
Método usado para realizar a MD, sofware e comparação com o experimento
Publication: Protein Solvation in ionic liquid mixtures
Prezado, parabéns pelo trabalho.
1) Vocês usam mecânica molecular para fazer as dinâmicas, certo? Qual campo de força vocês usaram?
2) Vocês desenvolveram algum programa para coletar dados, realizar as análises ou outros?
3) É possível comparar algum dado da MD de voês com dados experimentais? Se sim, e se há dados experimentais disponíveis, qual(is)?
With nearly 200,000 papers published, Galoá empowers scholars to share and discover cutting-edge research through our streamlined and accessible academic publishing platform.
Learn more about our products:
This proceedings is identified by a DOI , for use in citations or bibliographic references. Attention: this is not a DOI for the paper and as such cannot be used in Lattes to identify a particular work.
Check the link "How to cite" in the paper's page, to see how to properly cite the paper