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Other
Abordagem
Publication: Computational design of synthetic receptors for drug detection: interaction between molecularly imprinted polymers and MDMA (3,4-methylenedioxymethamphetamine)
Boa tarde, Thais. Parabéns pelo trabalho!
Vocês chegaram a levar em consideração alguma correção de dispersão nos cálculos em algum momento? Acho que isso pode ser importante na descrição dessas energias de interação entre o template e os monômeros. O ORCA tem uma gama de possibilidades interessantes para se fazer isso.
Vocês têm intenção de abordar o sistema polimerizado também (A partir dos monômeros obtidos melhores candidatos)? Você acha que seria possível, por exemplo, com QM/MM?
Ao final, como eles podem ser utilizados como sensores? Vocês também selecionam monômeros com alguma propriedade específica que se altera e pode ser medida quando a molécula de interesse se liga nessa cavidade?
Obrigado!
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Other
fotoquímica
Publication: Benzazóis como potenciais sondas fluorescentes de DNA: Docking e Dinâmica Molecular
Boa tarde, Guilherme. Parabéns pelo trabalho!
Como seria essa avaliação fotoquímica? Não seria interessante/possível que previsões teóricas acerca da fotoquímica desses compostos fossem realizadas em etapas anteriores? Fico com a sensação que uma noção da fotoquímica desses compostos seria importante já na sua "triagem virtual".
Obrigado!
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Other
Contextualização
Publication: Reações Consecutivas de Dissociação de Hidrogênio da Etilamina no Meio Interestelar
Boa tarde, Deborah. Parabéns pelo seu trabalho! A contextualização que você fez ficou muito boa.
Pegando um gancho na pergunta do Mateus Augusto, a determinação de barreiras de energia entre as espécies que você está estudando vai ser muito importante para o seu trabalho, ainda mais que você pretende estabelecer um modelo cinético. Dê uma olhada no pacote ORCA, além de gratuito, ele tem umas opções interessantes (como o NEB e o ScanTS) que podem te ajudar a obter as devidas conexões entre os intermediários, reagentes e produtos das reações de seu interesse, além de encontrar os estados de transição entre eles.
Sucesso no seu projeto!
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Other
Condições de contorno
Publication: A numerical-variational solution of the Schrödinger equation for H2+
Boa tarde, Guilherme. Parabéns pelo trabalho!
Essas condições de contorno criadas têm alguma interpretação no seu problema físico?
Obrigado!
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Other
ZPE
Publication: Cálculo do Tunelamento em Potenciais de Duplo Poço através dos Parâmetros da Barreira
Boa tarde, Caio. Parabéns pelo trabalho!
Você calcula as energias nos pontos de mínimo e de máximo usando algum método de estrutura eletrônica e depois faz a regressão para o seu potencial, certo? As energias utilizadas levam em consideração correção de ponto zero ou elas de certa forma se compensam? Isso influencia tanto quanto a "qualidade" das energias eletrônicas obtidas em cada ponto?
Obrigado!
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