Olá, Alex! Tudo bem? Uma curiosidade sobre o seu trabalho é: qual o efeito da interação dos fármacos investigados com as bases nitrogenadas que justificam o emprego no tratamento da COVID-19? Uma outra curiosidade é se vocês pretendem fazer uma correlação entre as energias de interação dos fármacos com as bases nitrogenadas com as informações de reatividade (de maciez química) avaliadas.

Prezado Alex, Gostaria de tirar algumas dúvidas que estão listadas a baixo: 1) Nesse trabalho vocês só realizam somente cálculos de DFT? Os cálculos foram feito em vácuo ou usando algum método de solvatação?  2) Vocês pretendem utilizar cálculos de dinâmica molecular para comprovar os resultados de vocês? Sinceramente não acredito que somente através dos indices de Fukui e cálculos de DFT (feitos no estado fundamental) sejam eficientes para identificar bons inibidores para vírus e outras doenças. 3) Uma dica para aprimorar seu trabalho e obter resultados mais sólidos é realizar uma dinâmica molecular para cada uma das moléculas citadas no seu trabalho usando junto a uma proteina do Sar-Cov-2 como receptor. Dessa maneira você poderia realizar a análise mostrada em seu trabalho para conformações especificas devido a interação proteina molécula. Vale resaltar que a densidade eletrônica depende da conformação da suas moléculas dessa maneira os indices de fuikui apresentados no seu trabalho também irão mudar.   

Ola Alex, boa tarde !

Gostaria que explicasse o motivo de ter escolhido o nivel de calculo 6-31G(d), ao inves do 6-31G(d,p) como e comumente trabalhado na literatura. Na sua apresentacao parece que os calculos foram realizados no "meio vacuo". Caso positivo, nao seria interessante investir no "custo computacional" do uso do meio solvente ?

Obrigado. Parabens pelo trabalho  

Oi Alex, parabéns pelo trabalho. Realmente acaba sendo interessante analisar esses índices visando estimar a reatividade de compostos, no caso de fármacos eles são utilizados para calcular a reatividade dos grupos warheads presente em inibidores covalentes. No seu caso, pelo que entendi, você está tentando relacionar com as interações intermoleculares de acordo com a maciez, a abordagem é interessante, mas acredito que com uma simples docagem molecular você iria conseguir obter essas informações de uma maneira mais direta, como as dicas que o Graziâni comentou e eu estou de acordo no outro tópico. Falar que eles terão uma boa interação somente pela maciez global, acho que não é totalmente correto, seria necessário avaliar as interações não covalentes que esses fármacos realizam com o alvo viral (a enzima RdRp). Então, na verdade esse comentário é mais uma dica para você incluir outras metodologias para obtenção de seus resultados, como docagem e dinâmica molecular.

Olá Alex! Eu tenho algumas dúvidas:

(1) Existe alguma estrutura obtida por cristalografia de raios-X para complexos envolvendo as bases nitrogenadas, esses dois medicamentos e a RNA-polimerase? Se houver, não seria mais interessante calcular esses descritores eletrônicos para as geometrias obtidas do cristal? Sim ou não? 

(2) Outro aspecto interessante que poderia ser explorado é como os descritores locais que você calculou sugerem que seja o mecanismo de ação desses medicamentos. Outros fenômenos químicos importantes podem ser explorados, como a tautomerização do Favipiravir, por exemplo.