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Tryptophan as target of excited carbonyls: Damage and suppression
Luiz Ramos
Química Fundamental / Instituto de Química / Universidade de São Paulo
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Trp is investigated as a target for excited species
Products arising from the attack of excited and radical species to Trp are identified
Trp might protect biomolecules from damage caused by carbonyl
Franciane Gonçalves dos Santos
Olá Luiz, parabéns pela apresentação!
Gostaria de saber se existem faixas valores pré-determinados de Ksv que podem definir ou distinguir os mecanismos envolvidos durante a supressão? E como você relaciona o mecanismo difusional no contexto da aplicação do seu trabalho?
Obrigada!
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Luiz Ramos
Olá Franciane, tudo bem?
Vamos ver se consigo te ajudar...rs
1 - Considerar o mecanismo como difusional depende de fatores como mobilidade das moléculas envolvidas e viscosidade do solvente. sendo que Ksv = kq.t, geralmente para um mecanismo difusional o valor de kq é próximo ao kdiff do solvente, e geralmente os valores se situam entre 10^9-10^10 M-1.s-1 (não consegui colocar subscrito e sobrescrito...rs). E junto com isso experimentos variando a temperatura também pode trazer informações sobre o mecanismo difusional e estático envolvido (livros como o do Turro e do Lakowicz detalham bem essas teorias...)
2- No caso deste trabalho, o mecanismo difusional pode inferir que todas as moléculas do supressor conseguem colidir com a espécie excitada (Ac3*) do mesmo jeito. Como a geração Ac3* é iniciada enzimaticamente (dentro de um sítio ativo) podemos supor duas linhas de raciocínio. (i) o Trp consegue difundir muito rapidamente a "barreia proteica" e suprimir a Ac3* no sitio ativo protegendo a enzima/biomolécula de possível dano, ou/e (ii) a Ac3* estar fora do sítio ativo, o que poderia causar dano em diversas biomoléculas, e neste caso o Trp tbm consegueria suprimir eficientemente proteger outras biomoléculas destas especies reativas. existem na literatura informações capaz de embasar as duas suposições acima.
Espero ter ajudado um pouco....rs
Franciane Gonçalves dos Santos
Obrigada, excelente explicação!