Metabolic profile analysis of Fabaceae plant species from Caatinga biome using metabolomic tools
Details
- Presentation type: Exposição de Pôster
- Track: Produtos Naturais - QPN
- Keywords: chemical diversity; Metabolomics; Molecular Network; ChemRICH; LC-MS/MS;
- 1 Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP), Universidade de São Paulo (USP)
- 2 Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho”
- 3 Universidade de São Paulo
- 4 Imperial College London
Metabolic profile analysis of Fabaceae plant species from Caatinga biome using metabolomic tools
Danielle Rocha Pinho Barros
Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP), Universidade de São Paulo (USP)
Abstract
Chemical Mapping of species belonging to Fabaceae in the Caatinga.
Use of GNPS and ChemRICH in the search for metabolic patterns.
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Danielle Rocha Pinho Barros
Olá Alana, muito obrigada!
Sim, o uso do NAP (do inglês, Network Annotation Propagation) se faz após a construção da Rede Molecular (RM). O NAP realiza uma predição in silico através das informações adquiridas dos compostos anotados durante a construção da RM, com auxílio de outras bases de dados como o Super Natural II consegue gerar uma lista espectral de compostos possíveis para os nodos que não apresentaram anotações. Na plataforma do GNPS há o acesso ao NAP, você irá informar o ID da sua RM já construída e configurar alguns parâmetros, segue o link da documentação na plataforma do GNPS e uma referência para leitura.
https://ccms-ucsd.github.io/GNPSDocumentation/nap/
Da Silva R.R., Wang M, Nothias L.F., et al. Propagating annotations of molecular networks using in silico fragmentation. PLoS Comput Biol., 14(4),1-26. 2018.
Espero ter ajudado estou à disposição fique a vontade para me enviar email.
Abraço