Development of Trypanosoma brucei sirtuin-2 inhibitors by fragment optimisation

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  • Presentation type: Sessão Coordenada PG - Pós Graduando
  • Track: Química Medicinal - MED
  • Keywords: Fragment-based drug design; epigenetics; Human African Disease; Cheminformatics;
  • 1 Faculdade de Ciências Farmacêuticas - USP

Development of Trypanosoma brucei sirtuin-2 inhibitors by fragment optimisation

Renan Augusto Gomes

Faculdade de Ciências Farmacêuticas - USP

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Renan Augusto Gomes

Obrigado pelo seu rico comentário, Bruno! Vamos lá: (i) a simplificação molecular foi adotada para que encontrássemos compostos com maior versatilidade sintética do que o hit identificado inicialmente, porém com atividade próxima a dele. Como mostrado nos slides, encontramos estruturas interessantes que enriqueceram as perspectivas do trabalho apresentado, como o 2-mercaptobenzotiazol, por exemplo. (ii) Concordo que a sensibilidade dos ensaios bioquímicos são geralmente menores, mas confirmamos os hits com curvas de concentração-resposta em ensaios independentes. (iii) Análises sobre inibição covalente, agregação e presença de PAINS foram realizadas de forma que os resultados apresentados refletissem apenas inibidores não-covalentes e que a inibição fosse consequência da ocupação do sítio de ligação da enzima parasitária. (iv) A análise de scaffolds foi realizada e foram encontrados 40 Murcko scaffolds diferentes em nossa biblioteca! (v) Dois algoritmos diferentes de ancoragem molecular foram adotados para guiar essa etapa do trabalho. (vi) A análise de hotspots foi realizada também e regiões do sítio de ligação puderam priorizadas na etapa de crescimento dos fragmentos. Os resultados não apresentados aqui farão parte da minha tese. Mais uma vez agradeço a contribuição e o comentário! Abraço.

Author

Renan Augusto Gomes

Obrigado, Gustavo! Abraço.

Author

Renan Augusto Gomes

Obrigado, Gustavo! Abraço.