Aplicação de Métodos Computacionais no Estudo do Mecanismo de Ação de Enzimas Essenciais ao Vírus Zika
Details
- Presentation type: Apresentação de Pôster / Poster Communications
- Track: Computational Chemistry
- Keywords: Vírus Zika; QM/MM; dinâmica molecular; Umbrella Sampling;
- 1 Department of Medicinal Chemistry / College of Pharmacy / University of Utah
- 2 Universidade Federal de Pernambuco - UFPE
- 3 Department of Medicinal Chemistry and Center For Natural Products, Drug Discovery and Development / College of Pharmacy / University of Florida
Aplicação de Métodos Computacionais no Estudo do Mecanismo de Ação de Enzimas Essenciais ao Vírus Zika
Maria Carolina Lima
Department of Medicinal Chemistry / College of Pharmacy / University of Utah
Abstract
O vírus Zika (ZIKV) é um vírus essencialmente transmitido por artrópodes, principalmente por mosquitos do gênero Aedes (Ae. Aegypti).
O processo de replicação viral é mediada por co- e pós-tradução de proteases do hospedeiro e por dois componentes da própria protease do vírus, o domínio protease da NS3 e a NS2B.
A proposta desse trabalho é a compreensão detalhada do mecanismo e a identificação das espécies intermediárias na reação catalisada pela protease de serina ZIKV.
Utilizando dinâmica molecular com método híbrido QM/MM e com método de amostragem Umbrella Sampling.
Obtemos o perfil energético para a primeira etapa da reação com energia livre de 33,62 kcal/mol.
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Maria Carolina Lima
Olá Vinícius Bonatto,
Desde já agradeço pela pergunta!
Com relação ao vírus Zika, existe um trabalho publicado em 2019. Eu tenho trabalhado para avaliar melhor o efeito da molécula de água na região do sítio ativo (incluir 1 a 3 moléculas na região), ou seja, comparar os perfis de energia.
Nós também queremos usar os inibidores análogos ao TS.
Muito Obrigada.
Vinícius Bonatto
Oi Maria, obrigado pela resposta. Entendi, agora ficou mais claro em relação as águas para comparar os perfis de energia. E, realmente, uma excelente opção a utilização de inibidores análogos ao TS.