GENOMAS COMPLETOS DOS CLOROPLASTOS DE ACROCOMIA INTUMESCENS E A. TOTAI, COMPARAÇÃO ESTRUTURAL E PADRÕES DE DINÂMICA EVOLUTIVA

O gênero Acrocomia inclui oito espécies, das quais A. aculeata (Jacq.) Lodd. Ex Mart., A. intumescens Drude e A. totai Mart. apresentam interesse econômico. Possuem alto teor de óleo, sendo fontes nativas de produção de alimentos e biodiesel. A tecnologia de sequenciação de nova geração tornou acessível a obtenção de sequências completas de cloroplastos. Essa organela é semiautônoma, com informação genética própria, e é tipicamente herdada de forma uni parental, sem recombinação. Relatamos os genomas completos dos cloroplastos de A. intumescens e A. totai. Foi possível investigar: (1) conteúdo gênico; (2) comparações estruturais; (3) repetições de sequência única (SSR) e dispersas; (4) sítios de edição de RNA e (5) a evolução da família Arecaceae em filogenia com esses genomas. Os genomas apresentaram 156,590 bp (A. intumescens) e 156,604 bp (A. totai), estrutura quadripartida com duas cópias simples (cópia simples grande-LSC e pequena-SSC), e duas repetições invertidas (IRA e IRB). Foram identificados 85 genes codantes de proteínas, 8 de rRNAs e 38 de tRNAs. Foi observado alto nível de sintenia em Acrocomia com relação a outras palmeiras e poucos rearranjos. Entretanto, expansões/contrações foram identificadas nas IRs. Em relação aos SSRs, 72 e 69 foram detectados em A. intumescens e A. totai e 43 repetições dispersas nas duas espécies. Esses valores tendem a ser conservados em palmeiras do mesmo gênero, sendo uma importante informação filogenética. Considerando os sítios de edição de RNA, entre as duas espécies, foram detectadas 77 conversões. Comparando com Bactris gasipaes e Syagrus romanzoffiana que pertencem à mesma tribo, Cocoseae, foram compartilhados 70 sítios. Na filogenia, as espécies A. intumescens e A. totai foram classificadas como irmãs e então, irmãs em relação a A. aculeata. Foi identificado um padrão consolidado entre os genomas, com mudanças estruturais sutis, e fornecidos recursos para análises evolutivas e conservação da família Arecaceae.