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América Central es uno de los cinco hotspots de diversidad de plantas a nivel mundial. Investigaciones recientes han destacado la importancia de la biodiversidad centroamericana y han proporcionado nuevas perspectivas sobre la historia evolutiva y la formación de las comunidades de especies de palmeras en la región. Al enfocarse en el reservorio genético de Acrocomia aculeata en América Central, se ha identificado una diversidad genética históricamente subestimada. Este estudio presenta el primer enfoque utilizando GBS (ddRAD-Seq) para explorar la diversidad genómica y los patrones biogeográficos de A. aculeata en toda América Central, mediante marcadores SNP. Se recolectaron un total de 259 muestras en Guatemala, Honduras, Nicaragua, Costa Rica y Panamá. Nuestros resultados revelaron tres principales grupos genómicos: Mesoamericano, Costarricense y Panameño, cada uno con subpoblaciones distintas y diferentes niveles de diversidad genética. El grupo Mesoamericano presentó la mayor diversidad genética y variación distinta, posiblemente reflejando rutas migratorias históricas provenientes de América del Sur. Barreras biogeográficas como la Depresión de Nicaragua y la Cordillera de Talamanca influyeron en la diversidad genética de A. aculeata en América Central. Los patrones de biodiversidad en la región reflejan los procesos de conexión geológica entre América del Norte y América del Sur. La modelación de nicho ecológico destacó la idoneidad de las tierras bajas de la región para la especie. Estos hallazgos son fundamentales para la conservación del germoplasma y el mejoramiento de la especie, con el objetivo de preservar la diversidad genética y la resiliencia de las poblaciones de A. aculeata en toda su distribución.
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