Objetivo: Analisar e comparar a tendência temporal da completitude do SINASC nas cidades brasileiras da coorte BRISA. Método: Estudo realizado com dados do SINASC das cidades de São Luís do Maranhão e Ribeirão Preto- São Paulo. Estudo da completitude seguindo um sistema de escores, compreendendo série temporal de 1996-2013. A análise de tendência se fez por estimação de modelos de regressão polinomial. Resultados: Dentre as variáveis com tendência decrescente para a incompletude, as que tiveram maior coeficiente de determinação ajustado em São Luís foram idade (R2= 0,98), índice Apgar 5 (R2= 0,92) e índice Apgar 1 (R2= 0,91). Já em Ribeirão Preto foram as variáveis escolaridade (R2= 0,90), gestação (R2= 0,88) e gravidez (R2= 0,76). Conclusão: Mesmo prevalecendo tendência predominante do tipo decrescente para incompletude do preenchimento nas duas cidades, Ribeirão Preto que tem boa estruturação dos serviços e gestão de saúde apresentou escores excelentes de completitude do preenchimento mais precoce que em São Luís quando se compara a série temporal.