Esta pesquisa teve como objetivo avaliar o Programa de Qualificação das Ações em Vigilância em Saúde (PQAVS) no Sistema de Informação de Agravos de Notificação (SINAN) e no processo de descentralização das ações de Vigilância em Saúde nas Gersas do Estado de Santa Catarina no período de 2012 a 2015. Métodos: A pesquisa realizada foi exploratória, descritiva, documental, tipo avaliativa com abordagem quantitativa, feita por “triangulação” de métodos. As estruturas, processos e resultados foram pesquisados nos dados do SINAN NET. O referencial teórico de Donabedian para a avaliação em saúde. Resultados: A pesquisa indicou possibilidades do SINAN como ferramenta de apoio para a gestão do trabalho e avaliação do PQA-VS. No indicador 6, no ano de 2012 o Estado atingiu a meta com 93,2%; em 2013, 90,85%; 2014, 85,60% e 2015 90,85%. No indicador 7 em 2012, 95% das Gersas atingiram a meta, 2013 foram 100%, em 2014 65%, e 2015 50%. O dimensionamento pessoal desigual dos interlocutores do SINAN em relação à carga de trabalho, intercorrências na atualização do sistema, irregularidade das ações de educação permanente no SINAN foram as possíveis explicações encontradas para os resultados obtidos pelas Gersas nos indicadores 6 e 7 do PQA-VS no Estado. Conclusão: As evidências indicaram que um processo de trabalho é eficiente e eficaz na gestão do trabalho com a gestão da educação permanente envolvendo municípios, Gersas, e Estado, contribuindo para a conquista das metas pactuadas, a qualidade do SINAN com índices menores de morbidades e melhor qualidade de vida da população.