Objetivos: Investigar a associação entre Transtorno do Espectro do Autismo (TEA) e o uso de medicamentos, tabaco, álcool e outras drogas. Métodos: Realizou-se um estudo de caso-controle. Para cada criança/adolescente com TEA (grupo-caso) selecionou-se quatro neurotípicas (grupo-controle). Como instrumento de coleta de dados, utilizou-se um questionário semiestruturado que foi aplicado às mães. Análise bivariada foi realizada com utilização dos testes Qui-Quadrado e Mann-Whitney. Resultados: O grupo-caso foi constituído por 248 crianças e adolescentes e o grupo-controle por 886, sendo semelhantes quanto a média de idade (p=0,398) e a classe social (p=0,320). A média de idade das mães foi de, respectivamente, 29,7 e 27,8 anos nos grupos caso e controle (p=0,000). Observou-se que um baixo número de mães relatou consumo de tabaco (2,8%), álcool (6,6%) e drogas ilícitas (1,7%) durante a gestação. Não foi identificada associação significativa entre o TEA e o uso dessas drogas (tabaco, p=0,721; bebida alcoólica, p=0,984; e drogas ilícitas, p=0,493). Entretanto, a proporção de mães que utilizou medicamento durante a gestação foi significativamente maior no grupo-caso (50,0%) quando comparada ao grupo-controle (35,5%) (p=0,000). Dentre as classes de medicamentos utilizadas, os antitérmicos/analgésicos (p=0,000), antibióticos (p=0,013) e antidepressivos (p=0,039) apresentaram associação com o TEA. Conclusões: A proporção do uso de medicamentos durante a gestação foi maior em mães de crianças com o TEA, e as classes que apresentaram associação com esse transtorno foram antitérmicos/analgésicos, antibióticos e antidepressivos. Nenhuma associação foi observada com o uso de outras drogas.