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Objetivo: Estimar a frequência de indicadores antropométricos da qualidade de mensuração de crianças menores de 5 anos. Métodos: Dados provenientes do Sistema de Vigilância Alimentar e Nutricional (SISVAN) do Brasil. A população de estudo compreende 13.037.025 crianças menores de 5 anos que tiveram o primeiro acompanhamento registrado no período de 2008 a 2016. Os indicadores avaliados foram frequência de valores faltantes em altura e peso, índice de dissimilaridade de altura e peso, frequência de valores biologicamente implausíveis (VBI) para os índices nutricionais altura para idade (A-I), peso para idade (P-I) e índice de massa corporal para idade (IMC-I). Após a exclusão dos VBI, calculou-se o desvio-padrão (DP) dos índices nutricionais. Resultados: A frequência de meninas foi de 52,09%. No primeiro acompanhamento, 57,48% das crianças tinham entre 2 e 5 anos. A frequência de valores faltantes para altura foi de 0,20% e para peso de 0,17%. O índice de dissimilaridade de altura foi de 89,17 e o de peso foi de 46,74. A proporção de VBI foi de 4,79% no índice A-I, 2,55% no índice P-I e de 1,86% no índice IMC-I. O DP do índice A-I foi de 1,76, o DP do índice P-I foi de 1,34 e o DP do índice IMC-I foi de 1,56. A frequência de VBI reduziu com o aumento da idade, e observou-se disparidades regionais com frequências maiores de VBI nas regiões Nordeste e Norte. Conclusão: Os indicadores avaliados indicam qualidade insuficiente na mensuração das variáveis antropométricas de crianças menores de 5 anos.
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