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O Programa Pesquisa para o SUS (PPSUS) é um programa desenvolvido pelo Ministério da Saúde que busca promover o desenvolvimento técnico e científico nas diversas realidades dos municípios brasileiros. O projeto “IntegraDTNs” faz parte deste programa, objetivando analisar padrões epidemiológicos e operacionais relativos à vigilância, prevenção e controle da Hanseníase e da doença de Chagas. Nesse sentido, este relato de experiência é construído a partir desta pesquisa de campo com objetivo de demonstrar as experiências vivenciadas pelos assistentes de pesquisa durante a coleta dos dados no território da atenção primária à saúde (APS) de dois municípios do sudoeste baiano. Dentre os resultados foi observado a influência dos determinantes sociais da saúde no território, principalmente a vulnerabilidade, limitando o acesso e as ações de combate e prevenção das doenças; a importância de conhecer o território e o perfil da população assistida, devido aos conhecimentos distintos sobre as doenças dentro da macrorregião, sendo um desafio na aplicação do questionário, orientações e ações descritas no projeto. A presença dos Agentes Comunitários de Saúde e Agentes de Endemias foi de extrema relevância, bem como facilitador para inserção da equipe nos municípios. Diante disso, a experiência e coesão da equipe adquiridas ao longo do processo de campo foram fundamentais para superar os desafios impostos. Destaca-se a necessidade de estabelecer vínculo entre a equipe da pesquisa com os profissionais que atuam na atenção básica, reconhecendo neste território a potência para prestação do cuidado em saúde no SUS.
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