Rede de interação e co-expressão para P5A ATPase ATP13A1

As ATPases transportadoras da família P5A estão envolvidas na homeostase do cálcio no retículo endoplasmático, citoplasma e núcleo. Esta enzima participa de funções básicas do retículo endoplasmático, como enovelamento e processamento de proteínas, estando expresso em todos os tipos celulares. A ausência de P5A ATPAses em microrganismos unicelulares, como leveduras, induz a resposta à proteína mal enovelada, como resultado do estresse do retículo endoplasmático, uma das características de células tumorais. O objetivo deste trabalho é buscar a rede de interação e de co-expressão do gene humano ATP13A1, assim como a sua expressão em diferentes tipos de tumores. As análises do gene ATP13A1 foram realizadas utilizando ferramentas e bancos de dados públicos disponíveis nas plataformas GENEMANIA, para estruturar a rede de interações, Cancer Cell Metabolism Gene DB, para a análise da co-expressão e a plataforma UALCAN que usa bancos de dados públicos TCGA para a análise da expressão em tumores. Na rede de interação de ATP13A1 destacamos a presença de “interactors” de homeostase do cálcio, como Ca2+-ATPase ATP2C1 e ATP2C2, chaperona Ca2+-dependente calnexina (CANX), que atua em processo de apoptose induzida por estresse do RE. Em análise da rede de co-expressão de ATP13A1, identificamos CHERP (Calcium Homeostasis Endoplasmic Reticulum Protein), uma proteína do RE importante na homeostase do cálcio, crescimento e proliferação. CHERP está co-expressa com ATP13A1 em HSNC (carcinoma de cabeça e pescoço), LUAD (adenocarcinoma de pulmão) e LUSC (carcinoma pulmonar de células escamosas), tipos de tumores em que a expressão de ATP13A1 é elevada, quando comparada com tecido normal. CHERP e ATP13A1 formam uma rede de interação por meio de NXF1, fator de exportação de RNA nuclear, SFSWAP, fator de regulação de splicing e SUGP1, que desempenha um papel importante no splicing pré-RNA. Esses resultados indicam a importância de ATP13A1 na manutenção da homeostase do cálcio do RE, assim como na resposta ao estresse do RE, por ativação da via de sobrevivência UPR e programas transcripcionais, de células tumorais.