Análises genômicas de bactérias do gênero Azospirillum

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Detalhes
  • Tipo de apresentação: Pós-Graduação-Poster
  • Eixo temático: 4.2 UENF - PPG Biotecnologia Vegetal
  • Palavras chaves: genômica comparativa; Bioinformatica; Biotecnologia;
  • 1 Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro

Análises genômicas de bactérias do gênero Azospirillum

Isabella De Oliveira Pinheiro

Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro

Resumo

Bioinoculantes constituem uma abordagem promissora para a intensificação sustentável da agricultura. Dentre as bactérias frequentemente usadas em bioinoculantes, a espécie diazotrófica Azospirillum brasilense ocupa papel de destaque. No entanto, ainda são raros os estudos sistemáticos e comparativos para o gênero utilizando genomas disponíveis publicamente. Neste trabalho, buscamos analisar os genomas de Azospirillum em busca de novas espécies associadas à promoção do crescimento vegetal, biocontrole e biorremediação. Para tal, inicialmente, os genomas foram baixados do Genbank/NCBI. A qualidade da montagem foi avaliada utilizando as ferramentas QUAST, BUSCO e CheckM. As métricas de distância foram estimadas através dos softwares MASH e fastANI, entre os genomas da família Azospirillaceae. A identidade média de nucleotídeos (ANI) foi computada com o módulo PYANI. Para a predição gênica, foi utilizado o software PROKKA. A partir das métricas de distância estabelecidas entre os representantes da família Azospirillaceae, foi possível selecionar, com confiabilidade, todos os genomas pertencentes ao táxon Azospirillum. A análise de ANI resultou em dois clusters principais, formados por isolados de A. brasilense e A. tiophilum. Constatou-se maior diversidade genética entre os isolados que não pertenciam a esses agrupamentos. Entretanto, deve-se ponderar sobre vieses decorrentes da grande proporção de genomas de A. brasilense. A partir das ORFs - Open Reading Frame - preditas, esperamos realizar a anotação funcional dos genes de interesse. Também realizaremos a reconstrução filogenética e a predição do viruloma e resistoma do gênero. Abordagens amplas e sistemáticas de genômica comparativa, como as apresentadas aqui, permitem explorar a diversidade gênica do gênero, constituindo uma importante estratégia para a prospecção e estudo de espécies de interesse biotecnológico.

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