Microrganismos halofílicos crescem em altas concentrações de sais acumulando cátions, como o potássio e/ou produzindo metabólitos que ajudam na adaptação ao ambiente. Eles são representados por várias classes de componentes orgânicos, possuem baixo peso molecular e são altamente solúveis em água. As ectoínas (ectoína e a hidroxiectoína) têm chamado atenção por serem agentes protetores, podendo estabilizar enzimas, nucleotídeos, e até mesmo células inteiras contra os efeitos deletérios do congelamento, ressecamento e aquecimento. A produção em larga escala é feita pelo uso da bactéria Halomonas elongata. Após o cultivo com altas concentrações de NaCl, um processo chamado de ordenha bacteriana (“bacterial milking”) é feito, onde um choque hipo-osmótico faz com que as células liberem a molécula. A cultura pode ser reaproveitada em até 9 ciclos. Outras bactérias também estão sendo estudadas, podendo listar Brevibacterium epidermis (DSM 20659) e um mutante de Escherichia coli.