O processo de fermentação semi-sólida tem papel de destaque no aproveitamento de resíduos sólidos, sendo um processo simples, de fácil recuperação de metabólitos gerados e de síntese de compostos de alto valor agregado, a exemplo de enzimas pectinolíticas. O presente trabalho utiliza a metodologia do planejamento experimental fatorial completo 22+3, com triplicata de todos os experimentos, e análise de superfície de resposta para avaliar a influência da umidade e proporção da mistura de resíduos, casca de coco verde e sabugo de milho, na síntese das enzimas pectinase e poligalactunorase. O extrato enzimático alcançou atividade de 13,76 ± 1,58 de U/g para pectinase e 45,08 ± 4,56 U/g para poligalactunorase. Através da metodologia de superfícies de resposta, a umidade e a proporção foram significativas para a síntese de pectinase (significância de 0,05). Somente a umidade foi significativa para a atividade enzimática da poligalactunorase, com o mesmo nível de significância.