Biodiesel é um biocombustível obtido a partir da reação de transesterificação de óleos vegetais com alcoóis de cadeia curta, que pode ser catalisada por lipases imobilizadas. Para diminuir o custo do processo, o biocatalisador pode ser recuperado, lavado com solvente e reutilizado. Assim, foram avaliados os efeitos do solvente (etanol, n-butanol e n-hexano) em três lipases comerciais imobilizadas (Novozym 435, Lipozyme RM IM, Lipozyme TL IM). Os biocatalisadores foram incubados nos solventes por 4 h a 50 ºC. A suspensão foi centrifugada e com o sobrenadante foi realizada a análise do teor de proteínas. A atividade de esterificação da preparação enzimática, bem como a análise de Microscopia Eletrônica de Varredura, antes e após incubação no solvente foram determinadas. A análise por MEV mostrou uma alteração significativa da estrutura da Novozym 435 após incubação em n-hexano, enquanto que para a lipase Lipozyme TL IM, esse efeito foi visualizado, principalmente, com etanol.