Integração de Parâmetros Físico-Químicos e Machine Learning para a Identificação de Epítopos

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Resumo

Este estudo propõe um método para classificar epítopos em três categorias: MHC classe I, MHC classe II e epítopos de células B, utilizando dados do Immune Epitope Database (IEDB) e técnicas de aprendizado de máquina. A classificação de epítopos é importante para o desenvolvimento de vacinas e terapias imunológicas, pois permite identificar alvos específicos e prever respostas imunes. Parâmetros físico-químicos foram usados para representar as sequências de aminoácidos. O modelo Random Forest (RF) obteve os melhores resultados, com acurácia de 84,32% e F1-score macro de 0,8276, destacando-se na classificação de MHC I (F1-score de 0,9557).

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Instituições
  • 1 Universidade Estadual Paulista (UNESP), Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira
  • 2 Universidade Federal de Alfenas
  • 3 Universidade Estadual Paulista, Faculdade de Engenharia de Ilha Solteira, UNESP
  • 4 Universidade Estadual Paulista “Júlio de Mesquita Filho”
Eixo Temático
  • ST02 - Biomatemática
Palavras-chave
Sistema Imune
Imunoterapia
Antígenos
Random Forest
Classificação